盾叶薯蓣转录组分析及其皂苷元生物合成关键酶基因的挖掘

• 作者: 孟庆博 张苗 智惊宇 李雅静 王丰青 耿晓桐 谢彩侠 陶晓赛
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 盾叶薯蓣 转录组 皂苷元 关键酶基因 高通量测序
• 年，卷（期）: 2018,（16）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 3885-3894
• 页数: 10页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2018.16.024

摘要

目的 分析比较盾叶薯蓣根茎与叶片的转录组,挖掘与盾叶薯蓣中皂苷元生物合成途径相关的关键酶基因.方法 利用Illumina HiSeq2000高通量测序技术对盾叶薯蓣根茎与叶片进行转录组测序,对测序结果进行注释分析;并结合根茎与叶片中皂苷元的含量测定结果,挖掘与盾叶薯蓣中皂苷元生物合成途径相关的关键酶基因;最后利用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)技术对部分候选基因的表达模式进行分析.结果 共获得了81 660个Unigene,有64.33％在NT、NR、Swiss-Prot、KOG、GO、KEGG数据库中得到注释;根据其表达量与代谢通路分析筛选出29种共227个可能参与盾叶薯蓣中皂苷元生物合成途径的催化酶基因,部分催化酶基因的表达模式与皂苷元含量具有一定相关性;并发现5个盾叶薯蓣内生菌基因.结论 研究初步获得了盾叶薯蓣中参与皂苷元生物合成的候选关键酶基因,部分候选酶基因可能参与盾叶薯蓣中皂苷类成分的后修饰过程,并发现盾叶薯蓣根茎中内生菌可能参与其皂苷元的生物合成,为进一步阐明盾叶薯蓣中皂苷元生物合成的分子机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢彩侠		94	284	9.0	12.0
2	王丰青		34	188	8.0	12.0
3	智惊宇		6	8	2.0	2.0
4	耿晓桐		5	5	1.0	2.0
5	张苗		7	20	3.0	4.0
6	李雅静		6	9	2.0	3.0
7	孟庆博		1	0	0.0	0.0
8	陶晓赛		2	1	1.0	1.0