牦牛KDM2A基因克隆及其在不同组织和减数分裂进程的表达

• 作者: 李键 杨显英 熊显荣 蔡雯祎 阿果约达 韩杰
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牦牛 组蛋白赖氨酸去甲基化酶2A基因(KDM2A) 卵母细胞 生物信息学 基因表达
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1186-1194
• 页数: 9页
• 分类号: S823.8+5.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2018.07.010

摘要

组蛋白去甲基化酶(histone demethylase,KDM)2A是细胞周期基因表达所必需的调控分子.为了研究牦牛(Bos grunniens)KDM2A基因的结构和功能,并进一步分析该基因在不同组织及卵母细胞减数分裂进程中的表达模式,本研究首先克隆获得牦牛KDM2A基因序列全长3 546 bp,包括完整的开放阅读框3 489 bp,编码氨基酸1 162个(GenBank登录号:MH345760).牦牛KDM2A基因与其他物种的相似度与构建的系统进化树结果一致.牦牛KDM2A蛋白分析显示,其理论分子质量为132.7 kD,理论等电点为7.59,不稳定指数52.73,总平均亲水指数-0.587.KDM2A蛋白氨基酸序列中存在117个磷酸化位点,6个N-糖基化和2个O-糖基化位点;二级结构包括无规则卷曲、α螺旋和β折叠.KDM2A蛋白含有cupin超家族jumonji-C(JmjC)结构域、锌指(CXXC zinc finger,ZF-CXXC)结构域、植物同源域(plant homeodomain,PHD)、F-盒蛋白(F-box,FBOX)结构域和有丝分裂相关蛋白(antagonist of mitotic exit network protein 1,AMN1)结构域,不含跨膜结构域和信号肽,主要在细胞核发挥生物学功能.KDM2AmRNA在子宫、脾脏和卵巢的表达量较高,极显著高于其他组织(P＜0.01);KDM2A mRNA在卵母细胞减数分裂过程中均表达,其中MⅡ期的表达量极显著高于GⅤ期和MⅠ期(P＜0.01),GⅤ期KDM2A的表达水平高于MⅠ期,但差异不显著(P＞0.05).本研究成功克隆了牦牛KDM2A基因序列,并明确其在组织和卵母细胞减数分裂进程中的表达模式,为深入探讨KDM2A基因在牦牛卵母细胞减数分裂进程中的作用机制提供了基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李键	西南民族大学生命科学与技术学院	117	464	10.0	15.0
2	熊显荣	西南民族大学生命科学与技术学院	39	109	6.0	7.0
3	杨显英	西南民族大学生命科学与技术学院	7	13	3.0	3.0
4	韩杰	西南民族大学生命科学与技术学院	7	13	3.0	3.0
5	阿果约达	西南民族大学生命科学与技术学院	7	13	3.0	3.0
6	蔡雯祎	西南民族大学生命科学与技术学院	7	14	3.0	3.0