中华蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的可变剪切基因分析

• 作者: 付中民 李龙 熊翠玲 王海朋 赵红霞 郑燕珍 郭睿 陈大福
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 中华蜜蜂 幼虫肠道 球囊菌 胁迫 可变剪切
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 1313-1318
• 页数: 6页
• 分类号: S891
• 字数: 4415字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0490-6756.2018.06.031

摘要

基于前期已获得的中华蜜蜂(简称中蜂)幼虫肠道转录组数据,利用TopHat2软件在正常(AcCK)及球囊菌胁迫的中蜂幼虫肠道样品(AcT1、AcT2、AcT3)中共鉴定出发生于9124个基因的57327个可变剪切事件,其中以基因间(17.68％)、可变3'端剪切(15.32％)、外显子跨越(14.12％)和可变5'端剪切(12.81％)类型为主.Venn分析结果显示4个肠道样品的共有可变剪切基因数为8111个,特有可变剪切基因数分别为272、189和385个.GO分类结果显示共有可变剪切基因涉及47个条目,AcT1、AcT2、AcT3的特有可变剪切基因分别富集于24、20和34个条目.KEGG代谢通路富集分析结果显示,共有可变剪切基因富集在327个代谢通路,基因富集数最多的是RNA转运、内质网蛋白加工及核糖体;AcT1、AcT2、AcT3的特有可变剪切基因分别富集在22、46和83个代谢通路.结果揭示了可变剪切基因在宿主的胁迫响应过程中的重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	付中民	福建农林大学蜂学学院	33	121	6.0	9.0
2	陈大福	福建农林大学蜂学学院	47	227	8.0	12.0
3	熊翠玲	福建农林大学蜂学学院	17	53	4.0	6.0
4	郭睿	福建农林大学蜂学学院	19	42	4.0	4.0
5	赵红霞		13	27	3.0	4.0
6	郑燕珍	福建农林大学蜂学学院	14	45	4.0	6.0
7	王海朋	福建农林大学蜂学学院	4	8	1.0	2.0
8	李龙	福建农林大学蜂学学院	3	11	2.0	3.0