四川地区猪细环病毒1型的流行病学调查和分子特征研究

• 作者: 何欢 宝志鹏 岳华 张斌 覃思楠 阮文强 陈新诺
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪细环病毒1型 分子流行病学 全基因组 进化分析
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 19-23
• 页数: 5页
• 分类号: S852.651|S852.659.2
• 字数: 3662字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2018.03.004

摘要

为了解猪细环病毒1型(TTSuV1)在四川地区猪群中的流行情况及其遗传进化关系,采用PCR对四川省不同地区的5个规模化猪场采集的140份临床健康猪血清进行检测,并根据 NCBI 已发表的TTSuV1的全基因组序列,对 TTSuV1中的2个亚型 TTSuV1 a 和 TTSuV1 b 进行全基因的扩增.结果显示,在140份临床健康猪血清样本中 TTSuV1a 和 TTSuV1b 的阳性检出率分别为49.29%(95% CI:40.7%~57.9%)和39.29%(95%CI:31.1%~47.9%).通过克隆转化,序列测定后拼接获得TTSuV1a的近似全基因组长为2497 bp,TTSuV1b 为2693 bp,对测得序列进行同源性和遗传进化分析.结果表明,扩增得到TTSuV1 a的 ORF1和 ORF2序列,与国内外已发表的参考毒株间的核苷酸同源性分别为79.3 %~97.5%和92.7%~98.2%,TTSuV1b 的 ORF1、ORF2序列与其他参考毒株间的核苷酸同源性分别为100%和97.1 %~98.6 %,分析表明其差异较小,亲缘关系较近.研究结果为四川省部分地区猪群中 TTSuV1的流行情况提供数据参考,为进一步研究TTSuV的遗传进化提供一定的理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何欢	西南民族大学生命科学与技术学院	10	27	3.0	4.0
2	陈新诺	西南民族大学生命科学与技术学院	8	22	3.0	4.0
3	阮文强	西南民族大学生命科学与技术学院	4	5	1.0	2.0
4	覃思楠	西南民族大学生命科学与技术学院	4	5	1.0	2.0
5	宝志鹏		1	1	1.0	1.0