湖南省长沙市番茄黄化曲叶病毒的检测与系统发育分析

• 作者: 刘勇 张宇 张德咏 张松柏 彭静 郑立敏 鲁清华
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 番茄黄化曲叶病毒 番茄 检测 湖南长沙
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 植物保护·农业气象
• 页码范围: 1332-1337
• 页数: 6页
• 分类号: S436.412.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2018.07.11

摘要

[目的]对湖南省长沙市发生的疑似番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)样本进行检测,明确TYLCV在湖南长沙的发生情况,为TYLCV的防控提供科学依据.[方法]2016年3和11月,在湖南长沙采集疑似TYLCV样本48份,采用已发表的TYLCV不同株系的全基因组序列,利用DNAMAN进行序列比对,根据保守序列设计特异性引物TY-T-F和TY-T-R、TY-P-F和TY-P-R对番茄样本的DNA进行PCR、Southern印迹杂交(Sourthern blotting)检测和系统发育分析.对呈阳性条带的PCR产物进行切胶回收并送样测序,在NCBI上进行BLAST比对分析,利用系统发育分析TYLCV湖南长沙分离物与国内外株系的相似性.[结果]采集的48份样本中有42份样本能扩增出目的条带,阳性检出率为87.5％;将42个阳性克隆序列导入MEGA 7.0,得到27个分离物.对测序结果进行同源性分析、多重比对、聚类分析及进化分析,结果显示27个湖南长沙TYLCV分离物与我国其他省(市)分离物的相似性在98.5％～99.8％,与伊朗株系(AJ132711和GU076453)、墨西哥株系(FJ012358)、澳大利亚株系(GU178814)和葡萄牙株系(AF105975)的相似性分别介于90.7％～91.5％、95.4％～95.5％、98.6％～98.8％和99.3％～99.4％.[结论]TYLCV已在湖南长沙发生危害,需加强检疫工作,防止从疫区调运感病番茄,以控制病害扩散蔓延.