1-脱氧野尻霉素与糖代谢酶相互作用的分子动力学计算

• 作者: 周虹 唐忠海 李林 李清明 苏小军 郭时印
• 来源期刊: 现代食品科技
• 关键词: 1-脱氧野尻霉素 分子对接 分子动力学模拟
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 工艺技术
• 页码范围: 143-148,243
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13982/j.mfst.1673-9078.2018.6.019

摘要

1-脱氧野尻霉素(DNJ)是从桑叶中发现的一种天然生物碱,由于其结构与葡萄糖相似,可竞争性抑制糖苷酶活性,从而显著降低多糖的降解水平.本试验采用分子对接和分子动力学模拟方法,从PTP1B、PPARα、PPARy、α-淀粉酶(α-Amylase)和α-葡萄糖苷酶(α-Glucosidase)等蛋白中确定了DNJ的作用靶标,并阐明其作用模式.结果表明,α-Glucosidase与DNJ的结合力有绝对优势,进一步的氢键分析和能量分解结果表明,Glu268、Asp330和Asp199是关键残基,在DNJ与α-葡萄糖苷酶结合中有重要作用,其作用方式是形成稳定的氢键作用,静电力作用和极性溶剂化能是主要的结合力来源.DNJ小分子通过与上述关键残基的作用稳定结合在α-葡萄糖苷酶口袋内部,从而抑制α-葡萄糖苷酶的生物活性,发挥降血糖作用.上述研究从分子结构层面阐明了DNJ和α-Glucosidase的作用模式,为基于DNJ结构进行理想药物的设计和小分子数据库的虚拟筛选提供了参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭时印		95	656	14.0	21.0
2	李清明		103	766	13.0	23.0
3	苏小军		63	344	10.0	16.0
4	李林		102	740	16.0	23.0
5	唐忠海		28	120	7.0	10.0
6	周虹		8	21	3.0	4.0