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猪圆环病毒2型吉林分离株的全基因组序列分析
猪圆环病毒2型吉林分离株的全基因组序列分析
作者:
刘东旭
尹柏双
苗丽娟
原文服务方:
中国兽医杂志
猪圆环病毒2型
全基因组序列
序列分析
摘要:
采用PCR扩增l株吉林新分离的PCV2-2017全基因组序列,经过测序拼接后进行了序列分析.毒株PCV2-2017基因全长1 767 bp,在GenBank上进行同源性比对,同源性在96% ~ 99%之间;与法国株AF055394同源性可达99%,与美国株AF055391、四川株HM102350同源性最低,为96%.PCV2中ORF1编码Rep蛋白,核苷酸和氨基酸同源性达到99%,ORF1突变很小,相对保守;ORF2基因全长为702 bp,编码Cap蛋白,氨基酸同源性达94% ~ 99%,核苷酸同源性与美国株比对,可达96%,与法国株和国内部分毒株同源性达99%,是变异主要发生部位,共有12处点突变;ORF3编码蛋白,核苷酸同源性高达100%,说明变异不大.基因的遗传进化分析表明,PCV2-2017吉林新分离株全基因组与法国株AF055394亲缘关系最近,同属于PCV-2b亚型;与AY322001、AB426905和国内GU370064、AY691169、AY969004、DQ180393毒株亲缘关系较远.
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文献信息
篇名
猪圆环病毒2型吉林分离株的全基因组序列分析
来源期刊
中国兽医杂志
学科
关键词
猪圆环病毒2型
全基因组序列
序列分析
年,卷(期)
2018,(11)
所属期刊栏目
调查研究
研究方向
页码范围
7-9
页数
3页
分类号
S852.659
字数
语种
中文
DOI
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节点文献
猪圆环病毒2型
全基因组序列
序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国兽医杂志
主办单位:
中国畜牧兽医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0529-6005
CN:
11-2471/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1953-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
12894
总下载数(次)
0
总被引数(次)
54031
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