鳜不同孵化时期miRNA转录组分析及生长相关miRNA鉴定

• 作者: 周昊天 宋凌元 曹晓颖 涂翰卿 赵岩 赵金良 黄思颖
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 鳜 高通量测序 microRNA 发育 生长
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 181-189
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2018-0261

摘要

MicroRNA是一类20-24 nt核苷酸长度的参与基因转录后水平调控的非编码小分子RNA.利用高通量测序技术获得鳜(Siniperca chuatsi)孵化后第3天、第17天和第28天全鱼miRNA转录组,共鉴定出1 084个miRNAs,其中432个已知、624个保守、28个新发现.第17天时鉴定出的miRNA个数最多,为926个.在3个发育时期都表达的有628个miRNAs,只在各时期中特异表达的分别有71、104和70个miRNAs.一些与鳜发育相关的miRNAs在上述3个时期呈现持续上调或下调的表达特点.进一步的实验表明,miR-199-5p和miR-203可能与鳜生长发育相关,相应的靶基因分别是WnT和MyoD.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵金良	上海海洋大学农业部	64	384	11.0	14.0
2	赵岩	上海海洋大学农业部淡水产种质资源重点实验室	17	91	5.0	9.0
3	黄思颖	上海海洋大学水产科学国家级实验教示范中心	2	2	1.0	1.0
4	涂翰卿	上海海洋大学水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心	6	16	2.0	4.0
5	曹晓颖	上海海洋大学水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心	3	2	1.0	1.0
6	周昊天	上海海洋大学水产科学国家级实验教示范中心	1	0	0.0	0.0
7	宋凌元	上海海洋大学农业部淡水产种质资源重点实验室	1	0	0.0	0.0