菊花抗白色锈病相关基因CmDREBa-2的克隆及表达分析

• 作者: 延昕 毛洪玉 熊超明 贾红梅 赵兴华
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 菊花 CmDREBa-2 基因克隆 生物信息学分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 977-987
• 页数: 11页
• 分类号: S682.1+1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2017-0441

摘要

以菊花(Chrysanthemum morifolium)免疫白色锈病品种‘C029’为试验材料,基于白色锈病病原菌诱导的菊花转录组数据库,采用RACE (rapid-amplification of cDNA ends)方法克隆得到菊花DREB(Dehydration responsive element binding protein)基因,命名为CmDREBa-2.对其进行生物信息学分析和表达分析,结果表明:CmDREBa-2开放阅读框(ORF)全长291 bp,编码96个氨基酸;预测CmDREBa-2蛋白相对分子质量为11 159.04,pI为11.34,是一个定位于细胞核、亲水的不稳定蛋白;氨基酸序列和结构分析显示该蛋白含有1个由49个氨基酸残基组成的AP2保守结构域,所以该蛋白属于AP2/EREBP家族;进化树分析表明CmDREBa-2属于DREB家族的A-1组,CmDREBa-2蛋白与菊花的其他两个DREB类蛋白CmDREBa和CmDREBb的同源性较高;菊花‘C029’接种白色锈病病原菌6h后,CmDREBa-2表达量达到最高,约为未接菌对照的34倍;用水杨酸(SA)、茉莉酸甲酯(MeJA)和乙烯利(ETH)处理‘C029’菊花叶片,结果表明CmDREBa-2受3种激素的诱导表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	毛洪玉	沈阳农业大学林学院	48	510	13.0	21.0
2	赵兴华	辽宁省农业科学院花卉研究所	48	186	8.0	11.0
3	贾红梅	沈阳农业大学林学院	4	15	2.0	3.0
4	熊超明	沈阳农业大学林学院	1	2	1.0	1.0
5	延昕	沈阳农业大学林学院	1	2	1.0	1.0