10种藏药材ccmFN基因片段密码子偏好性分析

• 作者: 张勇群 拉多 郝豆豆 雷鸣
• 来源期刊: 中成药
• 学科: 医学
• 关键词: 藏药材 ccmFN基因 密码子偏好性
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 饮片炮制
• 页码范围: 1551-1557
• 页数: 7页
• 分类号: R284.1
• 字数: 3976字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-1528.2018.07.023

摘要

目的 分析苞叶雪莲、砂生槐、西藏大戟、拉萨小檗、桃儿七、樱草杜鹃、大花黄牡丹、总状绿绒蒿、拉萨蒲公英、藏橐吾10种藏药材的ccmFN基因片段密码子偏好性.方法 运用Codon软件对ccmFN基因部分片段密码子组成、密码子使用性各参数和同义密码子相对使用度进行计算和统计分析,从而分析密码子的使用情况;利用ENC绘图、PR2绘图推测影响密码子偏性的因素.结果 ccmFN基因部分片段共同的偏好密码子为GCU、GAU、GAG、GGA、AUU、UUA、CUA、AAU、CCC、CAG、CGU、CGG,且偏好使用以U/A结尾的密码子.ENC绘图表明,10种单子叶植物受自然选择作用的影响比10种双子叶植物和10种藏药材大;PR2绘图表明,密码子第3位的碱基A和T使用不对称,从而影响密码子的偏好使用.结论 ccmFN基因部分片段密码子使用偏好性在苞叶雪莲等10种藏药材、10种双子叶植物、10种单子叶植物中差异不大,表明此区域在植物中具有保守性,突变作用是导致密码子偏好的主要因素.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	拉多		38	143	8.0	10.0
2	郝豆豆		8	16	2.0	3.0
4	雷鸣		16	27	3.0	4.0
5	张勇群		17	14	2.0	3.0