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毛竹NF-Y家族基因的鉴定与表达分析
毛竹NF-Y家族基因的鉴定与表达分析
作者:
傅鹰
周明兵
王思雨
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
毛竹
NF-Y家族
基因结构
系统发育树
表达谱
摘要:
为阐明毛竹NF-Y家族基因的结构、进化关系和表达情况,本研究利用水稻和拟南芥NF-Y家族的蛋白序列,通过Blast比对分析,鉴定出33个毛竹NF-Y家族基因.基于植物NF-Y亚家族成员的氨基酸序列特征,毛竹33个NF-Y家族成员分为3个亚家族,分别命名为PhNF-YA、PhNF-YB和PhNF-YC.构建毛竹、二穗短柄草、粟、水稻和拟南芥NF-Y家族系统发育树,结果表明,毛竹各NF-Y亚家族成员的进化趋势不同,与PhNF-YA亚家族相比,PhNF-YB和PhNF-YC在进化上较为保守,毛竹在NF-YA亚家族上可能出现了扩增,而在NF-YB和NF-YC两个亚家族上可能出现了成员丢失现象.通过Cufflinks等软件对毛竹7个组织材料的转录本深度测序数据分析,发现有些NF-Y家族基因在各器官中普遍表达,如PhNF-YA7、PhNF-YA3和PhNF-YB8在根茎叶中均有表达;有些NF-Y家族基因则在特定器官表达,如PhNF-YA1、PhNF-Y2、PhNF-YA4和PhNF-YA10在竹笋幼根表达.实时荧光定量RT-PCR分析毛竹NF-Y家族基因在毛竹笋各个组织的表达情况,结果表明,毛竹NF-Y家族基因在不同的节间组织中差异表达.本研究结果为进一步深入探究毛竹NF-Y家族基因功能奠定了理论基础.
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文献信息
篇名
毛竹NF-Y家族基因的鉴定与表达分析
来源期刊
核农学报
学科
关键词
毛竹
NF-Y家族
基因结构
系统发育树
表达谱
年,卷(期)
2018,(8)
所属期刊栏目
植物诱变育种·农业生物技术
研究方向
页码范围
1513-1527
页数
15页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.11869/j.issn.100-8551.2018.08.1513
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王思雨
浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室
2
10
2.0
2.0
2
周明兵
浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室
14
19
3.0
3.0
6
傅鹰
浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室
5
9
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被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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NF-Y家族
基因结构
系统发育树
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
核农学报
主办单位:
中国原子能农学会
中国农业科学院农产品加工研究所(前中国农业科学院原子能利用研究所)
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-8551
CN:
11-2265/S
开本:
16开
出版地:
北京市海淀区圆明园西路2号农产品加工研究所
邮发代号:
创刊时间:
1987
语种:
chi
出版文献量(篇)
4988
总下载数(次)
6
总被引数(次)
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