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盐芥EsABCG25的克隆及其表达分析
盐芥EsABCG25的克隆及其表达分析
作者:
唐帅
徐小静
松布尔巴图
陈宁美
陈悦
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
盐芥
ABCG25
生物信息学
Real-time PCR
表达分析
摘要:
旨在揭示盐芥(Eutrema salsugineum)ABCG25的结构及其对干旱、盐害以及温度等胁迫的响应.以山东生态型盐芥作为材料,通过电子克隆以及RT-PCR技术,获得一个腺苷三磷酸结合盒转运蛋白G(ABCG)家族成员基因的全长cDNA序列,命名为EsABCG25,GenBank登录号为KY111263.EsABCG25全长2 154 bp,含1 983 bp的开放阅读框,编码一个含有660氨基酸的蛋白分子.该基因定位于盐芥第5染色体,含有4个外显子和3个内含子.EsABCG25蛋白具有一个核苷酸结合结构域(NBD)和一个跨膜结构域(TMD),与来源于同科植物芜菁的ABCG25亲缘关系最近.对高通量测序数据分析表明该基因在盐芥的茎部表达最为丰富,在莲座叶中表达丰度最低,且在不同组织中均有可变剪接事件.Real-time PCR结果显示,该基因表达受多种逆境影响,尤其受到ABA的明显诱导.EsABCG25具有ABCG家族的典型序列特征;该基因在盐芥不同组织中的表达丰度存在差异,表达受到多种逆境的诱导,与盐芥的抗逆性关系密切.
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盐芥EsABCG25的克隆及其表达分析
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生物技术通报
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关键词
盐芥
ABCG25
生物信息学
Real-time PCR
表达分析
年,卷(期)
2018,(7)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
108-118
页数
11页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2018-0020
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
徐小静
中央民族大学生命与环境科学学院
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陈宁美
中央民族大学生命与环境科学学院
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唐帅
中央民族大学生命与环境科学学院
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松布尔巴图
中央民族大学生命与环境科学学院
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陈悦
中央民族大学生命与环境科学学院
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研究来源
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研究去脉
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期刊影响力
生物技术通报
主办单位:
中国农业科学院农业信息研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-5464
CN:
11-2396/Q
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区中关村南大街12号
邮发代号:
18-92
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
7180
总下载数(次)
42
总被引数(次)
53964
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