SCoT分子标记对茶枝柑及近缘种遗传多态性分析

• 作者: 席秀利 楼步青 王浩涵 詹若挺 黄海波
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 茶枝柑 SCoT分子标记 正交设计 遗传多样性 PCR反应
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 2426-2431
• 页数: 6页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2018.10.026

摘要

目的 采用SCoT分子标记方法对茶枝柑及近缘种进行遗传多态性分析.方法 使用正交设计方法,对Mg2+、dNTPs、ExTaq DNA聚合酶、引物浓度及模板DNA用量5个因素进行筛选,筛选适合茶枝柑及近缘种的SCoT-PCR反应体系,同时通过梯度温度筛选最佳退火温度,并验证其多态性引物.结果 得到适于茶枝柑的SCoT标记PCR反应体系,最终筛选出12条清晰、条带丰富的作为茶枝柑及近缘种SCoT分子标记的引物,同时通过NTSYS软件分析得到茶枝柑及近缘种的相似系数表和UPGMA聚类树.结论 运用3个不同地域柑橘基因组DNA对优化的SCoT-PCR反应体系进行验证,获得了多态性丰富、条带清晰的扩增图谱,表明茶枝柑SCoT分子标记技术体系稳定可靠.而聚类分析结果能够直观、科学地从分子角度对茶枝柑及近缘种13种材料进行初步区分.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	詹若挺		94	538	12.0	19.0
2	黄海波		40	304	10.0	15.0
3	席秀利		2	4	1.0	2.0
4	楼步青		3	14	2.0	3.0
5	王浩涵		4	5	1.0	2.0