利用定量蛋白组学的方法研究甲异靛诱导K562细胞凋亡的机制

• 作者: 刘璐 唐克晶 徐颖茜 毛新荷 王建祥 王敏 田征 邢海燕 饶青
• 来源期刊: 中国实验血液学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 慢性粒细胞白血病 K562 甲异靛 定量蛋白质组学
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 白血病基础与临床
• 页码范围: 1589-1597
• 页数: 9页
• 分类号: R733.72
• 字数: 4696字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7534/j.issn.1009-2137.2018.06.002

摘要

目的:利用串联质谱标签系统(tandem mass tag,TMT)标记定量蛋白组学的方法,检测白血病细胞系K562细胞经甲异靛(meisoindigo)处理后蛋白表达的改变,探讨甲异靛诱导白血病细胞凋亡的作用机制.方法:用CCK8法检测甲异靛对K562细胞的半抑制浓度(inhibitory concentration 50,IC50),流式细胞术检测不同浓度甲异靛诱导K562细胞的凋亡水平.K562细胞经终浓度为0.2％ DMSO(对照组)和20 μmol/L甲异靛(实验组)处理2h后,提取总蛋白,TMT标记,高效液相色谱分级和质谱定量蛋白组学技术鉴定肽段和丰度信息,并进行3次技术重复.用Mascot软件鉴定蛋白,用GO(gene ontology)注释、富集和聚类分析方法分析差异表达蛋白.结果:在K562细胞系中,甲异靛以剂量依赖的方式诱导K562细胞凋亡(r=0.98);蛋白质组学分析结果显示,共鉴定出蛋白质5 544个,其中有定量数据的蛋白质4 792个.与对照组相比,在实验组中表达差异1.5倍以上的蛋白有8个,其中4个蛋白表达上调,4个蛋白表达下调,差异变化的蛋白主要与活性氧代谢相关.结论:应用定量蛋白质组学分析表明,包括DDIT4等蛋白的表达在甲异靛处理K562细胞系早期发生明显改变,提示活性氧代谢过程的改变可能在甲异靛促进凋亡的机制中发挥了重要作用.