大白菜LOG基因家族的鉴定与生物信息学分析

• 作者: 刘振宁 孙琳 霍如雪
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 农学
• 关键词: 大白菜 LOG基因家族 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 18-26
• 页数: 9页
• 分类号: S634.101
• 语种: 中文
• DOI: 10.11937/bfyy.20173153

摘要

LOG基因编码5'-核糖单磷酸水解酶,将细胞分裂素的前体物质直接转化成具有生理活性的细胞分裂素,在细胞分裂素合成途径中具有重要作用.为深入研究大白菜LOG基因家族的功能,利用生物信息学方法对大白菜基因组中LOG基因家族成员进行了鉴定,并对其基因组信息、蛋白质生理生化特征、基因结构、保守结构域、系统进化等方面进行了研究.结果表明:在大白菜基因组中共鉴定出17个LOG基因,可以聚类到7个分支A～G中;LOG基因在大白菜10条染色体上呈现不均匀分布,在第2和4号染色体上分布相对较多;对大白菜LOG蛋白氨基酸序列进行了多重比对,比对结果表明LOG蛋白的氨基酸中均具有一致序列为MHxRKAxMx(5)FxALPGGYGTxxEE的LOG蛋白特异的LDC motif;通过MEME软件对大白菜LOG蛋白motif的预测发现了8个比较保守的motif.研究结果为大白菜LOG基因功能的研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘振宁	临沂大学农林科学学院	7	2	1.0	1.0
5	霍如雪	临沂大学农林科学学院	3	0	0.0	0.0
6	孙琳	临沂大学农林科学学院	2	0	0.0	0.0