SMRT测序技术及其在微生物研究中的应用

• 作者: 刘旭 唐勇
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 第三代测序 单分子实时测序 微生物
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 48-53
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017-1009

摘要

高通量测序技术的发展为研究者深入探索微生物世界提供可能.随着以Pacific BioSciences(PacBio)公司的单分子实时测序(Single molecule real time sequencing,SMRT)为代表的第三代测序(Third generation sequencing,TGS)技术逐渐发展成熟,微生物研究方法正面临又一次新的变革.SMRT测序技术凭借其特殊建库方式(SMRTbell)和超长的测序读长等特点,为微生物16S rRNA基因全长测序提供新的选择.同时,为组装完整可靠的宏基因组和微生物全基因组提供新方法.随着PacBio测序平台的成本大幅下降,SMRT测序技术的PacBio系列平台开始逐渐被应用于微生物16S rRNA基因测序、宏基因组测序和全基因组测序研究中.综述了SMRT测序技术的技术原理和特点及其在微生物16S rRNA基因全长测序、宏基因组测序等方面的应用,并分析了目前SMRT测序技术在微生物各方面研究中的优势和存在的问题,提出基于SMRT测序技术获得的长片段在后期分析中存在的问题.SMRT测序技术将越来越多地引入到微生物研究中,期望为将要选择使用SMRT测序技术研究微生物的研究人员提供一定参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐勇		13	38	4.0	5.0
5	刘旭		2	12	2.0	2.0