miR-340在膀胱尿路上皮癌中的表达及其靶基因预测的生物信息学分析

• 作者: 朱智荣 潘寿华
• 来源期刊: 浙江医学
• 关键词: miR-340 膀胱肿瘤 靶基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 560-563
• 页数: 4页
• 字数: 2663字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12056/j.issn.1006-2785.2018.40.6.2017-2219

摘要

目的 探讨miR-340在膀胱尿路上皮癌中的表达,并对其预测的靶基因进行生物信息学分析,为miR-340在膀胱尿路上皮癌发生中的作用机制研究提供理论基础.方法 采用miRNA芯片技术检测膀胱尿路上皮癌及正常膀胱黏膜组织中miRNA表达谱,用实时定量PCR法进行验证,挑选具有显著表达差异的miR-340为进一步研究对象,利用生物信息学方法,对miR-340的靶基因进行预测,并对其靶基因进行基因本体(GO)功能富集分析及KEGG信号转导通路富集分析.结果 miRNA表达谱芯片、实时定量PCR法均提示miR-340在膀胱尿路上皮癌中较癌旁正常膀胱组织中表达明显降低.miR-340预测靶基因集合功能富集于细胞黏附(cell adhesion)、生物黏附(biological adhesion)和细胞间黏附(cell-cell adhesion)等,KEGG通路分析涉及癌通路(pathways in cancer)和细胞周期通路(pathways in cell cycle)等.结论 miR-340在膀胱尿路上皮癌中呈低表达,miR-340预测靶基因集合显著富集在与肿瘤发生相关的信号通路中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘寿华	绍兴市人民医院泌尿外科	17	80	5.0	8.0
2	朱智荣	绍兴市人民医院泌尿外科	2	0	0.0	0.0