辣椒基因组中XTH基因家族的鉴定与表达特征分析

• 作者: 刘海清 吴智明 夏碧波 李宁 梁关生 沈瑶
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶 基因表达 果实发育与成熟
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 317-324
• 页数: 8页
• 分类号: S641.3
• 字数: 3994字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2018.02.016

摘要

为全面了解木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTH)基因在辣椒基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定出了所有辣椒XTH基因家族成员,并对基因的结构、染色体定位、系统进化关系和保守结构域等进行了预测,同时基于转录组数据集分析了XTH基因在辣椒不同器官、不同发育时期果实中的表达特征.结果表明,辣椒XTH家族包含23个基因成员,不均衡分布在除10号染色体外的其余11条染色体上;23个基因包含1～5个不等的内含子;系统进化分析表明,辣椒XTH蛋白可分为3个亚家族;基因表达特征分析显示,大多数辣椒XTH的表达具有组织特异性,CaXTH2、CaXTH21、CaXTH13和CaXTH23极有可能与辣椒果实的膨大与成熟相关.本研究为深入了解辣椒XTH基因的功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁关生	仲恺农业工程学院园艺园林学院	19	148	6.0	11.0
2	刘海清	中国热带农业科学院科技信息研究所	76	482	13.0	18.0
3	吴智明	仲恺农业工程学院园艺园林学院	25	135	7.0	10.0
4	夏碧波	仲恺农业工程学院园艺园林学院	3	8	2.0	2.0
5	沈瑶	仲恺农业工程学院园艺园林学院	2	3	1.0	1.0
6	李宁		1	3	1.0	1.0