利用Y染色体基因分析梅花鹿种公鹿的遗传多样性和父系起源

• 作者: 刘华淼 周永娜 张然然 王磊 董世武 邢秀梅 鞠妍
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 梅花鹿种公鹿 Y染色体 遗传多样性 父系起源
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 282-290
• 页数: 9页
• 分类号: S825.2
• 字数: 5339字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2018.02.007

摘要

旨在利用Y染色体基因研究梅花鹿种公鹿的遗传多样性和父系起源,为梅花鹿的保种育种工作提供数据支持.对171只双阳、敖东、四平、东丰、兴凯湖、长白山和东大梅花鹿种公鹿Y染色体上的AMELy、DBY、USP9Y、SRY基因的5个片段进行PCR扩增,对PCR产物进行直接测序和生物信息学分析.结果表明,5个基因片段共筛选到8个突变位点,AMELY1、AMELY2、DBY、USP9Y、SRY基因片段分别有3、2、1、1、1个突变位点.利用DNASP5.1软件共定义了10种单倍型,分别为H1、H2、H3、H4、H5、H6、H7、H8、H9、H10,其中H1是优势单倍型,占梅花鹿种公鹿群体的49.1％,H5和H10为东丰梅花鹿种公鹿独有,H9是最原始的单倍型.171只梅花鹿种公鹿的单倍型多样性为0.696 80,核苷酸多样性为0.000 36.NJ系统进化树和structure群体结构分析结果表明,梅花鹿种公鹿有3个父系类型,分别为Y1、Y2和Y3,除双阳梅花鹿种公鹿和四平梅花鹿种公鹿均来自Y3,其余梅花鹿种公鹿群体均为多父系类型.表明我国梅花鹿种公鹿Y染色体具有较高的单倍型多样性和极低的核苷酸多样性.