保加利亚乳杆菌CRISPR位点的序列分析

• 作者: 吕加平 程娜 蔡针华 贾震虎 逄晓阳
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 保加利亚乳杆菌 同源性 CRISPR 间隔序列 二级结构
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 基因编辑专题
• 页码范围: 87-93
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017-0952

摘要

乳酸菌基因组的CRISPR序列是乳酸菌识别并抵御噬菌体侵染的重要元件,其与cas蛋白共同构成了乳酸菌的获得性免疫系统.而目前对乳酸菌CRISPR序列信息研究较少.因此本文对8株不同来源的保加利亚乳杆菌的CRISPR序列进行了克隆测序,对其重复序列进行了遗传进化分析并预测了二级结构,同时进行了间隔序列的同源性分析.结果显示:8株保加利亚乳杆菌均含有长度不一的CRISPR区,最长的CRISPR序列片段长度为1820 bp,含有30条间隔序列,最小的CRISPR片段仅有408 bp,含5个间隔序列.经分析发现CRISPR重复序列的二级结构预测有两类不同的结构,一类以"环"为主的典型RNA二级结构,一类以"茎"为主,前者剪切后具有典型crRNA结构,而后者的功能还有待进一步研究.通过分析保加利亚乳杆菌的CRISPR序列结构,可为保加利亚乳杆菌抗噬菌体的分子机制奠定基础,也对乳品工业筛选抗噬菌体的发酵剂菌株具有指导意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吕加平	中国农业科学院农产品加工研究所	97	609	13.0	19.0
2	蔡针华	山西师范大学生命科学学院	2	2	1.0	1.0
3	程娜	山西师范大学生命科学学院	2	2	1.0	1.0
4	贾震虎	山西师范大学生命科学学院	27	61	5.0	6.0
5	逄晓阳	中国农业科学院农产品加工研究所	29	65	4.0	6.0