基于高通量测序下低拷贝乙型肝炎病毒检测方法的应用分析

• 作者: 谢丽明 赖伟兰 陈亚军
• 来源期刊: 国际检验医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肝炎病毒,乙型 聚合酶链反应 序列分析,DNA 突变
• 年，卷（期）: 2018,（23）
• 所属期刊栏目: 论著·临床研究
• 页码范围: 2937-2940
• 页数: 4页
• 分类号: R512.6+2|R446.1
• 字数: 3381字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4130.2018.23.023

摘要

目的 建立一种针对临床低拷贝乙型肝炎病毒(HBV)的检测方法.方法 选取2017年1-10月该院收治的乙型肝炎患者30例作为研究对象.采集患者血清样本进行HBV病毒基因组提取,通过HBV DNA定量检测试剂盒[聚合酶链反应(PCR)荧光探针法]对HBV DNA样本进行定量检测.选择HBV<4×103 copy/mL的病毒DNA 6例,分别进行全基因组一步法建库及巢式PCR扩增法建库.采用Illumina Miseq平台对构建好的文库进行测序.通过生物信息学方法对所得数据进行分析.结果 与HBV B型参考基因组比对,全基因组一步法建库匹配率很低,且数据产量低.巢式PCR扩增法建库匹配率达75.61％,且样本覆盖率及测序深度较好.6例低拷贝HBV样本共发现29个宿主内iSNV,且存在15个低频突变.结论 巢式PCR扩增HBV全基因组建库进行高通量测序可用于低拷贝HBV的检测,且能发现低频突变.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈亚军	韶关市妇幼保健计划生育服务中心检验与遗传中心	22	115	5.0	9.0
2	赖伟兰	韶关市妇幼保健计划生育服务中心检验与遗传中心	2	4	1.0	2.0
3	谢丽明	韶关市妇幼保健计划生育服务中心检验与遗传中心	1	3	1.0	1.0