菘蓝ItSnRK2.1基因的克隆及其序列特性分析

• 作者: 刘鹏 包乌日娜 向殿军 张春兰 满丽莉
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 菘蓝 ItSnRK2.1基因 克隆 特性分析
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 119-128
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017-0692

摘要

SnRK2是ABA通路中至关重要的蛋白激酶,可通过调节下游相关蛋白质的活性来调节胁迫响应基因的表达,显著改进植物对高盐和干旱等非生物胁迫的抗性.基于SnRK2成员cDNA的UTR保守区域设计兼并引物,利用RT-PCR方法从菘蓝中克隆得到一个SnRK2全长cDNA序列,命名为ItSnRK2.1.测序显示该基因长度为1305 bp,包含一个1071 bp的完整开放阅读框,编码356个氨基酸,在GenBank数据库的登录号为MF423122.ItSnRK2.1蛋白激酶理论等电点为5.64,理论分子量为40.6 kD,属于亲水性蛋白,存在二个显著跨膜结构域,含有42处磷酸化位点,没有信号肽,最可能定位的位置是在细胞质上.ItSnRK2.1蛋白激酶的二级结构具有151个 α-螺旋、109个无规则卷曲、66个延伸链和30个 β-转角.ItSnRK2.1蛋白包含一个ATP结合位点和一个丝氨酸/苏氨酸酶活结构域,同AtSnRK2.1、AtSnRK2.5和StSnRK2.6蛋白亲缘关系最近,处在同一进化分枝.实时定量RT-PCR检测结果显示,ItSnRK2.1基因在菘蓝幼苗的根部表达量最高,其次是叶,茎的表达量最低;ItSnRK2.1基因积极参与高盐和干旱胁迫应答反应,但对ABA胁迫不敏感,表明该基因可能与植物抗逆境胁迫有关,且不依赖ABA调控通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘鹏	内蒙古民族大学农学院	50	219	9.0	13.0
2	向殿军	内蒙古民族大学农学院	26	16	2.0	3.0
3	满丽莉	内蒙古民族大学生命科学学院	20	10	1.0	2.0
4	张春兰	内蒙古民族大学生命科学学院	20	27	3.0	4.0
5	包乌日娜	内蒙古民族大学农学院	5	5	1.0	2.0