3种PCR程序扩增甜菜SSR及InDel标记的比较

• 作者: 刘乃新 刘蕊 吴则东 吴玉梅
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: Touch down PCR 梯度PCR 固定退火温度PCR SSR标记 InDel标记
• 年，卷（期）: 2018,（30）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 76-80
• 页数: 5页
• 分类号: S566.3
• 语种: 中文

摘要

本研究旨在扩增出条带清晰、非特异性条带少的SSR/InDel标记产物.选择来自6个国家的12份不同基因型甜菜品种,利用SSR及InDel两种标记方法,Touch-down PCR、梯度PCR及常规固定退火温度PCR三种反应程序扩增产物.通过比较扩增产物的多态性、稳定性、清晰度选择适合两种分子标记方法的PCR反应程序.结果表明:Touch-down PCR法可以通过一次反应即顺利扩增出带型清晰,无无效带,扩增效果稳定的样本产物.梯度PCR法扩增结果不稳定,有非特异性条带出现并且弥散现象严重.固定退火温度PCR扩增结果因引物不同而差异较大,同时伴有弥散现象.Touch-down PCR扩增产物特异性,稳定性均高于梯度PCR及固定退火温度PCR,且较梯度PCR法省略了摸索最适退火温度的过程.因此,推荐使用Touch-down PCR程序进行甜菜SSR与InDel分子标记法研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘乃新	黑龙江大学农作物研究院	12	7	2.0	2.0
2	吴玉梅	黑龙江大学农作物研究院	21	43	3.0	6.0
3	吴则东	黑龙江大学农作物研究院	13	38	5.0	5.0
4	刘蕊	哈尔滨师范大学生命科学与技术学院	1	3	1.0	1.0