松材线虫Bx-Daf-22基因鉴定及表达

• 作者: 易家娴 李丹蕾 李仁 王峰 罗洪巍 陈俏丽
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 松材线虫 抗逆态幼虫 抗逆 固醇载体蛋白
• 年，卷（期）: 2018,（30）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 71-75
• 页数: 5页
• 分类号: S763.2
• 语种: 中文

摘要

为探究松材线虫抗逆态幼虫DL3形成的分子机理,对其鸟苷酸环化酶路径中的抗逆态基因Bx-Daf-22进行了鉴定和表达研究.笔者应用BLAST比对技术在松材线虫基因组数据中鉴定得到固醇载体蛋白SCP2同源基因,命名为Bx-Daf-22.根据松材线虫基因组数据设计引物,应用PCR技术扩增Bx-Daf-22完整蛋白编码区.进一步对Bx-Daf-22基因编码的氨基酸序列进行同源序列系统进化、系统发育分析、保守结构域分析和蛋白质三维结构比对等生物信息学分析.应用荧光定量Q-PCR对不同虫龄Bx-Daf-22表达丰度进行分析.结果表明:Bx-Daf-22由4个α螺旋,1个310螺旋位于碳(C)端,在1号和2号α螺旋中间包围着5个β折叠.Bx-Daf-22具有固醇载体蛋白SCP2构域,可将起始信号传递到cGMP路径的膜结合受体上,表明该蛋白可以完成cGMP路径中受体蛋白的功能.以二龄幼虫作为标准,抗逆态幼虫DL3的Bx-Daf-22表达量显著上调,雄成虫Bx-af-22表达量下调显著.Bx-Daf-22蛋白质结构及不同虫龄Bx-Daf-22表达量表明,该基因参与与cGMP路径且与DL3形成直接相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李丹蕾	东北林业大学林学院	31	106	6.0	8.0
2	王峰	东北林业大学林学院	47	250	9.0	12.0
3	陈俏丽	东北林业大学林学院	26	83	6.0	7.0
4	易家娴	东北林业大学林学院	1	1	1.0	1.0
5	李仁	东北林业大学林学院	1	1	1.0	1.0
6	罗洪巍	东北林业大学林学院	1	1	1.0	1.0