畲药搁公扭根基原植物及其同属易混种的ITS2条形码鉴别

• 作者: 吕群丹 姜程曦 方洁 潘俊杰 程文亮 程科军
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 畲药 搁公扭根 掌叶覆盆子 ITS2 DNA条形码鉴定
• 年，卷（期）: 2018,（13）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 3102-3109
• 页数: 8页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2018.13.022

摘要

目的 基于ITS2条形码序列对畲药搁公扭根及其同属易混种进行分子鉴定,以保证药材使用的正确性和临床疗效.方法 分别于浙江、广西、江西和安徽等地采集搁公扭根基原植物掌叶覆盆子及其9种同属易混种高粱泡、山莓、蓬藁、茅莓、插田泡、寒莓、东南悬钩子、三花悬钩子和武夷悬钩子样品共140份.对采集样品进行基因组DNA提取、ITS2基因片段PCR扩增并双向测序、拼接获得相应序列,基于HMMer方法注释获取ITS2序列,同时下载GenBank相应物种ITS2序列37条,使用Gene Tool软件分析ITS2序列长度、GC量、变异位点等情况,利用Clustal X和MEGA7.0软件计算种内、种间遗传距离,构建邻接(NJ)系统发育树.结果 搁公扭根及其9种同属易混种ITS2序列长度为211～213 bp,GC量为52.1％～58.0％;搁公扭根基原植物与其他物种共有14个变异位点,一处插入/缺失;搁公扭根种内平均K2P遗传距离为0.007 2,显著小于其他9个易混种,其中与山莓和武夷悬钩子进化距离最近,与蓬藁最远;NJ进化树中搁公扭根各单倍型序列单独聚为一支,可与其他物种成功区分.结论 ITS2序列能够成功鉴别搁公扭根基原植物及其9种同属易混种,为畲药DNA条形码分子鉴别提供了有力佐证,助力畲药流通信息监管.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	程文亮		18	77	4.0	8.0
2	程科军		13	28	3.0	4.0
4	方洁		6	11	2.0	3.0
5	吕群丹		6	8	2.0	2.0
6	姜程曦	温州大学生命与环境科学学院	19	109	4.0	10.0
7	潘俊杰		4	4	2.0	2.0