鸡miR-125b的组织发育性变化及其功能预测分析

• 作者: 孙桂荣 康相涛 张蒙 李国喜 李转见 蒋瑞瑞 闫峰宾 韩瑞丽
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡 miR-125b 进化 下丘脑 通路分析
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 基础兽医
• 页码范围: 43-51
• 页数: 9页
• 分类号: S831.2
• 字数: 5972字
• 语种: 中文

摘要

为了解miR-125b的进化历史和潜在的生物学功能,下载不同物种miR-125b前体序列,运用ClustalW2软件进行多序列比对,构建系统进化树,qPCR方法检测固始鸡不同组织中miR-125b表达量的发育性变化,通过Targetscan 7.0与miRDB数据库对miR-125b靶基因进行预测、DAVID数据库对预测的靶基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果显示:不同物种之间miR-125b具有很高的保守性;在胚胎期下丘脑中,随着胚胎发育,miR-125b的表达量逐渐增加,出壳后又呈现逐渐降低的趋势,到36周龄表达量又显著升高;在成年期消化器官(肌胃、腺胃、小肠、肝脏)中也具有较高的表达量;经预测,miR-125b靶基因有920个,富集于组织发育、生物调节、基因表达的转录后调节、小RNA的生物学加工等生物过程和细胞外基质受体相互作用、调节肌动蛋白细胞骨架、MAPK信号通路、胰岛素信号通路、不饱和脂肪酸的生物合成和NOD样受体信号等通路.结果表明:鸡miR-125b为广泛性时序表达miRNA,可能参与鸡胚胎期及出壳后生长发育相关的诸多生物学过程的调控.