北极狐酪氨酸酶基因cDNA序列分析及启动子预测

• 作者: 冯敏山 刘艳军 刘铮铸 巩元芳 张文香 彭永东 李祥龙 牛迪 郭敏
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 北极狐 酪氨酸酶基因 生物信息学分析 启动子 转录因子结合位点 结构功能
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 16-22
• 页数: 7页
• 分类号: S826.2
• 字数: 4499字
• 语种: 中文

摘要

为了探明北极狐酪氨酸酶(tyrosine,TYR)基因核心启动子活性区、转录因子结合位点、基因编码蛋白结构及功能,通过RT-PCR扩增及基因测序技术首次从北极狐皮肤组织中获得TYR基因cDNA序列,全长4 300 bp(包括5'侧翼区2 681 bp,CDS区1 593 bp,3'侧翼区26 bp).生物信息学分析结果表明:北极狐TYR基因5'侧翼区存在潜在的启动子区域,并发现TATA框和CAAT框等调控元件及髓细胞增生原癌基因(Myc)、胰十二指肠同源盒1(Pdx1)、V-Myb髓细胞组织增生病毒癌基因同源物(Myb)、E26转录因子1(Ets1)、特异性蛋白1(Sp1)和TATA盒结合蛋白(TBP)等多种转录因子.北极狐TYR基因编码蛋白的长度为530个氨基酸残基,编码蛋白是定位于生物膜上的不稳定可溶性亲水蛋白质,该蛋白以无规卷曲为主,主要参与信号转导和转录,存在跨膜区域和信号肽.北极狐与其他物种的系统进化树分析提示北极狐与家犬的遗传亲缘关系最近,不同物种间亲缘关系与生物进化观点基本一致,符合动物学分类.