不同苎麻品种根际土壤细菌多样性

• 作者: 汤涤洛 汪红武 涂修亮 潘国雄 熊伟
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 高通量测序 苎麻 土壤微生物 细菌多样性
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 植物保护·土壤肥料
• 页码范围: 538-543
• 页数: 6页
• 分类号: S563.1
• 字数: 4045字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2018.3.019

摘要

[目的]本文研究了不同苎麻品种根际土壤细菌群落组成和多样性的变化.[方法]利用Illumina平台Miseq高通量测序技术结合相关生物信息学对深根型、中根型、浅根型苎麻根际土壤细菌进行高通量测序及分析.[结果]测序共获得230 664个OTUs,257 100条读数,平均读长420 bp.Venn图表明不同处理之间共有的细菌OTU数目为459个,深根型苎麻与中根型苎麻共有的细菌类群最多.深根型苎麻Chao指数显著高于浅根型苎麻13.86％,与中根型苎麻差异不显著.深根型苎麻Shannon指数显著高于中根型苎麻,与浅根型苎麻差异不显著.3个处理间的Simpson指数差异不明显.Observed species指数、Chao指数、Shannon指数、Simpson指数总体上呈现深根型苎麻高于其他2个处理,说明深根型处理土壤细菌种群丰富度、土壤细菌优势度高于其他2种处理.苎麻根际土壤细菌多样指数与土壤有机碳、pH值相关性较高,与速效钾呈正相关关系.3个处理的土壤根际细菌优势门(相对丰度＞10％)、优势纲(相对丰度＞10％)、优势属(相对丰度＞1％)都基本相同.3个处理的土壤细菌优势门有拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria).3个处理的优势纲有拟杆菌纲(Bacteroidia),梭菌纲(Clostridia),芽孢杆菌纲(Bacilli).3个处理的优势属有18个.[结论]①与中根型、浅根型苎麻相比深根型苎麻根际土壤细菌最为丰富;②苎麻根际土壤细菌多样性与土壤有机碳、pH值相关性较高,与速效钾呈正相关关系;(③深根型、中根型、浅根型苎麻土壤根际细菌优势类群基本相同.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	涂修亮		25	52	4.0	5.0
3	潘国雄		3	7	2.0	2.0
5	汪红武		17	71	5.0	7.0
7	熊伟		7	11	3.0	3.0
11	汤涤洛		14	48	4.0	6.0