甜高粱蔗糖积累关键时期叶片转录组测序分析

• 作者: 张敖 王志和 赵质涵 阮燕晔 陈思孛 马爱军
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 甜高粱 成熟期叶片 转录组 糖分积累与代谢 蔗糖
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 98-104
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017-0876

摘要

通过转录组测序技术,在甜高粱糖分累积的关键时期寻找甜高粱和普通高粱组织间差异表达的相关基因,通过相关基因的功能注释及相关联的Pathway代谢通路分析,进一步筛选与糖分积累与代谢相关的基因,以利于为充分挖掘甜高粱的生物学潜能,改良高粱品种提高其茎杆的糖含量打下坚实基础.以甜高粱辽甜1号和粒用高粱新苏2号为材料,对甜高粱与粒用高粱在成熟期进行叶片转录组数据测序分析并比较,测序结果如下,共得到71.98 M条reads,总碱基数14.54 Gb.使用Cufflinks软件对reads进行组装,共发掘出1 562个新基因.通过差异表达筛选出3 115个差异基因,其中1 499个上调,1 616个下调.对差异基因进行GO、COG分类和KEGG代谢途径富集性分析,将这些差异表达基因归类于包括淀粉与蔗糖代谢途径在内的94个代谢途径,从淀粉与蔗糖代谢通路(Pathway ID:Ko00500)中取β-呋喃果糖苷酶、蔗糖合成酶、果糖激酶的5个差异基因分别为Sb06g031910、Sb06g023760、Sb01g035890、Sb01g033060和Sb10g0082805进行实时荧光定量分析,发现这些基因在不同生育时期的表达与其对应酶类的活性有紧密的联系,推测这些基因在甜高粱叶片的蔗糖合成及积累过程中发挥着至关重要的作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	阮燕晔	沈阳农业大学生物科学技术学院	69	786	15.0	26.0
2	张敖	沈阳农业大学生物科学技术学院	6	3	1.0	1.0
3	陈思孛	沈阳农业大学生物科学技术学院	1	2	1.0	1.0
4	赵质涵	沈阳农业大学生物科学技术学院	1	2	1.0	1.0
5	马爱军		1	2	1.0	1.0
6	王志和	沈阳农业大学生物科学技术学院	1	2	1.0	1.0