民猪与大白猪肠道菌群的比较研究

• 作者: 刘娣 张冬杰 张跃灵 王文涛
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 民猪 大白猪 16S rDNA 宏基因组测序
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 基础兽医
• 页码范围: 67-72
• 页数: 6页
• 分类号: S828
• 字数: 4563字
• 语种: 中文

摘要

民猪是我国一个著名的地方猪种,属于脂肪型猪种.而大白猪起源于欧洲,是瘦肉型猪种.通过比较这2个不同猪种间肠道微生物菌群的差异,分析它们在消化吸收上的异同点.首先针对16S rDNA V4区设计引物,对来自于5头大白猪和5头民猪的粪便基因组进行PCR扩增,利用Illumina Hiseq2000测序平台进行测序,数据经优化整理后,进行OTU聚类分析,并在门、纲、目、科和属共计5个水平上进行分类学统计.结果表明:共获得421～460 bp序列298 768条,占总数的99.98％.2组间共有OTU 885个,大白猪特有OTU 69个,民猪特有OTU 221个.共检测到25个门,其中拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、螺旋菌门(Spirochaetae)和变形菌门(Proteobacteria)占优势,民猪和大白猪之间具有大致相同的门水平分布.在检测到的207个属中,普氏菌属(Prevotella)和密螺旋体属(Treponema)的相对丰度值在2个猪种内均较高.而大白猪的厌氧弧菌属(Anaerovibrio)和梭菌属(Clostridium)分别比民猪猪高出4.5倍和3.4倍,民猪的纤维杆菌属(Fibrobacter)、螺旋体属(Spirochaeta)和密螺旋体属(Treponema)比大白猪分别高出3.7倍、1.6倍和1.7倍.由此推测,民猪肠道内纤维杆菌属的高表达可能与其易消化粗纤维饲料有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘娣	黑龙江省农业科学院畜牧研究所	251	803	12.0	15.0
2	王文涛	黑龙江省农业科学院畜牧研究所	77	68	5.0	5.0
3	张冬杰	黑龙江省农业科学院畜牧研究所	87	157	6.0	7.0
4	张跃灵	黑龙江省农业科学院畜牧研究所	2	1	1.0	1.0