云南切梢小蠹热激蛋白20基因克隆及序列分析

• 作者: 刘霞 杨诚 许玉
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 云南切梢小蠹 HSP20基因 基因克隆 序列分析 系统发育进化树
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 植物保护·农业气象
• 页码范围: 2425-2431
• 页数: 7页
• 分类号: S763.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2018.12.11

摘要

[目的]对云南切梢小蠹(Tomicus yunnanensis)成虫热激蛋白20基因(TynHSP20)进行克隆和序列分析,为研究该虫在高温环境下的抗逆机制打下基础.[方法]采用cDNA末端快速扩增技术(Rapid amplification of cDNA ends,RACE)克隆云南切梢小蠹成虫TynHSP20基因cDNA序列,并对其序列进行生物信息学分析.[结果]克隆获得的TynHSP20基因cDNA序列长671 bp,含开放阅读框597 bp,5'端非编码序列和部分3'端非编码序列分别为44和33 bp.该基因编码198个氨基酸,预测蛋白质分子量为22.50 kD,等电点为7.86,包含一个保守的α-晶体蛋白结构域.同源性比对分析结果表明,TynHSP20蛋白氨基酸序列与东亚飞蝗、蓼蓝齿胫叶甲、斜纹夜蛾和美洲斑潜蝇的HSP20氨基酸序列相似性均低于20％.系统发育分析结果显示,TynHSP20与沙葱萤叶甲的亲缘关系较近.[结论]成功克隆获得TynHSP20基因cDNA序列,该基因具有小热激蛋白家族的特征,但与其他物种小热激蛋白的同源性较低.