椰子种质资源遗传多样性的SSR分析

• 作者: 周丽霞 曹红星
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 椰子 遗传多样性 SSR 聚类分析 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 1683-1690
• 页数: 8页
• 分类号: S667.402.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2018.09.01

摘要

[目的]研究椰子种质资源的遗传多样性,为椰子育种材料的选择及遗传改良提供理论依据.[方法]从100对SSR引物中筛选出多态性引物,并利用其分析26份椰子种质材料的有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、Nei's基因多样性指数(H)、Shannon多态性信息指数(I)、多态信息含量(PIC)、多态性百分率(P)及遗传距离,并基于遗传距离对其进行聚类分析,以明确该椰子种质资源的遗传多样性及亲缘关系.[结果]筛选出的31对多态性SSR引物可扩增105个等位基因,平均每对引物扩增3.4个,各引物P为30.77％～84.62％,平均为63.28％;PIC为0.1596～0.8015,平均为0.4958.26份椰子种质材料中,马哇、小黄椰和越南红椰子的I、H和P均最高,分别为0.5501、0.3711和38.71％,云南-海74的I、H和P最低,分别0.2095、0.1583和19.35％.云南34021与云南34007的遗传距离最小,为0.206,三亚红椰-3与云南34024的遗传距离最大,为1.513.聚类分析结果表明,当遗传距离为0.670时,26份椰子种质被分为两大类,其中马哇和越南高种归为一类,剩余24份椰子种质归为另一类;当遗传距离为0.550时,26份椰子种质被分为四大类,即红矮、越南马可波罗、马哇和越南高种分别自成一类,其余22份归为一类.[结论]26份椰子种质的遗传多态性丰富,物种间亲缘关系较远,可为椰子遗传育种提供亲本材料.