基于宏基因组技术分析传统红茶菌中菌群组成及其主要代谢通路

• 作者: 徐伟 葛阳阳 陈翠婷 马婷婷
• 来源期刊: 食品工业科技
• 学科: 工学
• 关键词: 红茶菌 菌群组成 代谢通路 宏基因组
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 119-123,129
• 页数: 6页
• 分类号: TS201.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13386/j.issn1002-0306.2018.05.023

摘要

由于传统红茶菌发酵过程中,微生物的种类及数量随时间延长而不断变化,导致红茶菌发酵液代谢产物难以控制.采用高通量测序技术对发酵7d的传统红茶菌进行宏基因组测序,获得65771178个clean reads数据,经拼接组装,获得93449个Unigene片段.以BLAST(E-value＜ 1.0e-5)将Unigene对NR、KEGG数据库进行比对,与NR库比对共65515个Unigene得到注释信息,再将得到的注释信息根据GI(GenInfo Identifier)与物种分类的关系得到物种分类信息,分为细菌、真菌2个界,细菌界占96.57％,真菌界占3.40％,细菌的主要优势菌种是Gluconacetobacter sp.SXCC-1 (29.17％)、Komagataeibacter medellinensis(7.84％)、Komagataeibacter xylinus (7.58％),真菌的优势菌种是Brettanomyces bruxellensis(1.86％);与KEGG数据库比对,共47234个Unigene注释到KEGG的代谢通路中,分属338类代谢通路,其中有2475个Unigene参与氨基酸代谢过程,307个属于次生代谢途径.序列已提交至GenBank数据库,登录号SRP103682.利用宏基因组技术将传统红茶菌中的微生物鉴定到“种”的水平,同时了解红茶菌微生物群落的代谢机理,可以更有效地控制红茶菌的发酵进程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐伟	哈尔滨商业大学食品工程学院	45	205	8.0	12.0
2	马婷婷	哈尔滨商业大学食品工程学院	4	8	1.0	2.0
3	葛阳阳	哈尔滨商业大学食品工程学院	2	7	1.0	2.0
4	陈翠婷	哈尔滨商业大学食品工程学院	2	7	1.0	2.0