Label-free与iTRAQ蛋白质组学方法在IgA肾病中的应用

• 作者: 古丽米热 杨淑芬 陆晨
• 来源期刊: 广西医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 尿液蛋白质组 label-free iTRAQ IgA肾病
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 181-185
• 页数: 5页
• 分类号: R692.31
• 字数: 4601字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16190/j.cnki.45-1211/r.2018.02.011

摘要

目的:探讨蛋白质非标记(label-free)定量技术与同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术两种尿液蛋白组学技术在IgA肾病(IgA-N)中的应用价值.方法:选取正常人(健康对照组)和IgA-N患者(IgA-N组)各12例,均留取新鲜晨尿,组内混合,预实验判断样品质量,初步确定蛋白质鉴定数量,FASP酶解后分两部分进行:一部分iTRAQ标记分级后与另一部分进行label-free的LC-MS/MS质谱、数据分析.比较两种实验方法蛋白覆盖情况、实验重复性及差异蛋白数量.结果:经过质谱鉴定,label-free经质谱鉴定到的肽段长度7～26,高峰10～18,各肽段长度范围内的数目最多达800种.iTRAQ实验经质谱鉴定到的肽段长度6～26,高峰分布6～l6,各肽段长度范围内的数目最多达1400种.iTRAQ计算组内变异系数(CV)为5.7％～l1.2％,组间CV为7.9％～22.0％(CV＜0.3).Label-free实验计算组内CV为3.7％～13.2％,组间CV为5.9％～19.0％(CV＜0.3).Label-free鉴定到624种蛋白,iTRAQ鉴定到621种蛋白.通过火山图分析两种实验方法均可以很好筛选出差异蛋白,且聚类效果好;经GO分析两种实验方案均显示出相似度较高的生物分类功能.结论:iTRAQ标记可检测到更多的蛋白,且在低分子量检测中占优势,而label-free实验得到的CV相对较小,需要依据实验目的优化实验方案.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陆晨	新疆维吾尔自治区人民医院肾内科	131	587	12.0	18.0
2	杨淑芬	新疆医科大学研究生院	5	56	2.0	5.0
3	古丽米热	新疆维吾尔自治区人民医院肾内科	7	7	2.0	2.0