近年来,手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)肠道病毒病原谱发生改变,柯萨奇病毒A6 (coxsackievirus A6,CoxA6)型在国内、外HFMD暴发流行中成为主要病原体并引起了极大关注.目前针对CoxA6的研究尚不全面,尤其是关于CoxA6致病机制的研究资料较少.本综述综合分析了近年来HFMD病毒基因重组及其引起的临床症状的改变,CoxA6病原学及流行病学特征,为进一步防控HFMD提供科学依据.利用中国知网、PubMed、Web of Science中英文数据库,以“HFMD”“CoxA6”“病学原”“流行病学”为关键词,检索2015-01-2018-10相关文献.纳入标准:CoxA6型HFMD病原学及流行病学特征;CoxA6型HFMD临床特征及分子流行病学特征;HFMD病学原监测和流行分析.剔除标准:研究资料缺失或质量较差.最终34篇文献纳入分析.结果表明,自2013年以来,中国多个城市如上海、杭州和北京等HFMD暴发均以CoxA6型为优势毒株,该病毒呈现比由CoxA16引起的经典儿童HFMD更严重的临床表现,尤其是脱甲症较为典型且危害较大,其致病机制较为复杂且研究较少.CoxA6基因结构上基于近完全VP1核苷酸序列的进化分析显示,亚基因型D5系4株是2013年以来中国CoxA6相关HFMD持续暴发的原因.序列分析显示,VP1中有8个候选氨基酸替换,为CoxA6毒力增强的研究提供了有用的信息.肠道病毒在进化过程中常发生重组产生新型肠道病毒,目前全球主要流行的CoxA6也是重组进化后的新型变异株.中国上海、温州和广东等城市均有其基因重组研究,CoxA6病毒基因的重组不仅可能会引起HFMD临床症状的改变,而且核苷酸上累积的变异还可能使新型变异毒株的致病性增强,进而导致HFMD的暴发流行.提示CoxA6型引起的HFMD在病原学、流行病学及疫苗的研发等多方面需要进一步深入研究.