滇池沉积物中反硝化细菌及产甲烷菌的分子鉴别研究

• 作者: 华金珠 夏体渊 姚丽媛 尹利方 徐胜光 王定康 王家银 陈泽斌
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 滇池 沉积物 反硝化细菌 产甲烷菌 分子鉴别
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 园艺·农业生态环境
• 页码范围: 154-159
• 页数: 6页
• 分类号: Q948
• 字数: 3993字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2018.1.027

摘要

[目的]为了解滇池沉积物中反硝化细菌及产甲烷菌的种类组成.[方法]采用引物NirS1F/NirS6R和Me1/Me2分别对沉积物总DNA进行PCR扩增,得到1000 bp的反硝化细菌和760 bp的产甲烷菌特异性片段.[结果]证实了滇池沉积物中存在反硝化细菌和产甲烷菌,且推测产甲烷菌的丰度高于反硝化细菌.2个克隆文库分别获得阳性克隆子55和99个,利用Mothur软件将序列分别划分为10和5个OUT,说明尽管反硝化细菌的丰度低于产甲烷菌,但物种多样性高于产甲烷菌.运用BLASTN程序在GenBank数据库中进行序列比对,发现55个反硝化细菌阳性克隆子可分为10个种类,OTU10类序列与细菌Dechloromonas aromatica的相似性达86％,是反硝化细菌中的优势类群;99个产甲烷菌阳性克隆子可分为5个种类,OTU5类序列与甲酸甲烷规则菌(Methanoregula formicicum)相似性达86％,该类群是反硝化细菌中的优势类群.[结论]滇池沉积物中的反硝化细菌与产甲烷菌多为潜在的未被培养的新种.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王家银	云南省农业科学院农业经济与信息研究所	30	42	4.0	6.0
2	王定康	昆明学院农学院	47	216	8.0	12.0
3	陈泽斌	昆明学院农学院	57	191	7.0	10.0
4	姚丽媛	昆明学院农学院	13	18	3.0	3.0
5	华金珠	昆明学院农学院	15	23	3.0	4.0
6	尹利方	昆明学院农学院	12	15	3.0	3.0
7	夏体渊	昆明学院农学院	24	53	4.0	5.0
8	徐胜光		7	27	3.0	5.0