高通量技术在重症肺炎患者呼吸道病原体快速检测中的应用

• 作者: 冯翔 张金李
• 来源期刊: 检验医学与临床
• 学科: 医学
• 关键词: 重症肺炎 病原体 高通量测序 宏基因组
• 年，卷（期）: 2018,（16）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 2439-2440,2444
• 页数: 3页
• 分类号: R446
• 字数: 2446字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-9455.2018.16.023

摘要

目的 探讨不依赖序列的单引物扩增技术结合Ion Torrent高通量测序平台对重症肺炎患儿呼吸道肺泡灌洗液进行病毒病原体宏基因组检测的效果.方法 取临床重症肺炎患者肺泡灌洗液标本,进行病毒基因组核酸DNA/RNA的提取,随机引物扩增建库后,进行Ion Torrent高通量测序分析,测序结果 进行本地blast分析筛选病毒序列,运用MetaVir数据库进行病毒归类分析.结果一共获得591593条序列读长,病毒序列3545条,占0.6％,其中主要病毒及序列有腺病毒1760条(49.6％),淋巴囊肿疾病病毒1422条(40.1％),Taterapox病毒65条(1.8％),智利巨型病毒37条(1.0％),云杉卷蛾雕背姬蜂病毒33条(0.9％),猫白血病病毒32条(0.9％),网状内皮组织增生证病毒30条(0.8％),RD114逆转录病毒18条(0.5％);呼吸道病原体荧光定量聚合酶链反应结果为腺病毒7型,提示患者腺病毒7型感染.结论 该研究初步建立的病毒宏基因组分析技术平台可用于呼吸道相关已知和未知病毒病原体鉴定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张金李	河南省开封市中心医院检验科	5	8	2.0	2.0
2	冯翔	河南省儿童医院检验科	1	4	1.0	1.0