中国近海细鳞鯻线粒体控制区的遗传多样性

• 作者: 卢丽锋 吕金磊 杨喜书 章群 薛丹 黄镇宇
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: 细鳞鯻 线粒体控制区 遗传变异 种群结构
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1852-1859
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.5846/stxb201701180152

摘要

通过线粒体控制区序列的分析,研究采自中国南海及东海5个群体102尾细鳞鯻的遗传多样性.发现在962 bp序列中有205个变异位点,其中135个为简约信息位点,共定义102个单倍型.中国近海细鳞鯻总体呈现出较高的遗传多样性特征(Hd=1.000,Pi=0.022),其中博鳌最高(Hd=1.000,Pi=0.028),平潭最低(Hd=1.000,Pi=0.014).不同地理群体间无明显分化,基因交流频繁(Fst=-0.014-0.041,P＞0.05);中性检验均为显著负值,推测在16.9万年-5.06万年前,即中-晚更新世出现种群扩张.系统邻接树和单倍型网络图均出现3个显著分化的谱系(谱系间Fst=0.508-0.698,P＜0.001;净遗传距离Da=0.024-0.031),且各谱系中均有不同地理来源的群体.3个谱系间分歧时间大约在1.07百万年-0.24百万年前,推测可能是更新世冰期边缘海的出现导致群体隔离而产生分化.谱系A(Lineage A)包含85.3％的个体,其总体遗传多样性较高(Hd=1.000,Pi=0.012),其中平潭最高(Hd=1.000,Pi=0.014),合浦最低(Hd=1.000,Pi=0.010);群体间Fst在-0.021-0.068之间,P＞0.005;AMOVA分析显示只有1.97％的变异来自于种群间,表明群体间也无明显分化;中性检验均为显著负值,推测在25.4万年-7.6万年前出现种群扩张.中国近海细鳞鯻主要受到中-晚更新世海侵和海退的影响而出现种群扩张使得谱系间发生二次接触,最终形成具有显著谱系结构但无地理分化的情况.