基于高通量测序的南美白对虾中微生物群落分析

• 作者: 张宾 汤贺 章样扬 邓晓影 郝桂娟
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 工学
• 关键词: 南美白对虾 表面微生物 高通量测序 菌群分析
• 年，卷（期）: 2018,（24）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 149-155
• 页数: 7页
• 分类号: TS254.4
• 字数: 4970字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7506/spkx1002-6630-201824023

摘要

目的:分析不同状态下南美白对虾表面附着的微生物菌群组成情况.方法:以活体对虾、冰鲜对虾、冰鲜虾仁和冷冻虾仁为对象,通过对虾表面附着微生物提取及高通量测序分析,获得不同对虾样品中微生物组成及变化情况.结果:1)各样本有效序列范围为30 591～42 043条、操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)范围为68～168,其中冷冻虾仁OTU数量最低,而活体对虾和冰鲜对虾OTU数量相对较高.2)多样性指数分析发现,所有样品中以冷冻虾仁的ACE、Chao1和Shannon指数值最低、Simpson指数最高,表明其菌群丰度及多样性较低.3)在科水平上,相比于活体对虾,冰鲜对虾中莫拉氏菌科(Moraxellaceae)相对丰度显著增加,其可能与虾体死亡、微生物污染繁殖有关;冰鲜虾仁弧菌科(Vibrionaceae)相对丰度显著增加且含量最高,主要是虾仁加工制备环境及加工器具中微生物接触污染所致;而冷冻虾仁中主要以莫拉氏菌科(Moraxellaceae)、假单胞菌科(Pseudomonadaceae)、李斯特菌科(Listeriaceae)为腐败优势菌.4)热图分析发现,活体对虾和冰鲜对虾菌群结构整体相似度较高,二者与冰鲜虾仁、冷冻虾仁的相似度较低,表明虾仁制备过程、低温冻藏对于虾仁中菌群结构影响较大.5)主成分分析表明,冷冻虾仁与其他组别样本均相距较远,说明冷冻虾仁中微生物种类及组成与其他样品存在着较大差异.结论:南美白对虾样品处于不同状态时,其附着优势微生物、菌群结构、丰度及相互比例等存在显著差异,需针对于不同类型虾类制品,采取不同的控制工艺以保障虾类制品的质量与安全.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张宾	浙江海洋大学食品与医药学院浙江省海产品健康危害因素关键技术研究重点实验室	56	309	12.0	16.0
2	汤贺	浙江海洋大学食品与医药学院浙江省海产品健康危害因素关键技术研究重点实验室	4	20	2.0	4.0
3	邓晓影	浙江海洋大学食品与医药学院浙江省海产品健康危害因素关键技术研究重点实验室	3	19	1.0	3.0
4	郝桂娟	浙江海洋大学食品与医药学院浙江省海产品健康危害因素关键技术研究重点实验室	4	22	2.0	4.0