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印度块菌-云南松菌根际土壤细菌的种群组成和群落结构
印度块菌-云南松菌根际土壤细菌的种群组成和群落结构
作者:
刘培贵
刘建利
邓晓娟
闫兴富
原文服务方:
生态学报
印度块菌
云南松
菌根
细菌
高通量测序
培养
根际土壤
摘要:
以印度块菌-云南松菌根际土壤细菌为研究对象,研究其种群组成和结构特征.(1)稀释平板法分离得到印度块菌-云南松菌根际土壤细菌的纯培养菌株,对菌株的16S rRNA序列测序分析,对测序的菌株数量和得到的OTUs数量绘制物种累积曲线,当物种累积曲线趋于平缓时,对OTUs进行系统发育分析,揭示可培养细菌的种群组成和结构特征.(2)对印度块菌-云南松菌根际土壤细菌16S rRNA基因的V3-V4区进行高通量测序,分析全部细菌类群的种群组成和结构特征.(1)分离得到菌根际可培养细菌793株,分属于3个属的61个OTUs,其中假单胞菌属(Pseudomonas)序列占总序列的86%,不动杆菌属(Acinetobacter)序列占总序列的9.8%,链霉菌属(Streptomyces)序列占总序列的6.5%.假单胞菌是印度块菌-云南松菌根际土壤可培养细菌的绝对优势类群.(2)高通量测序得到菌根际细菌序列8937条,分属于20个门、198属、2073个OTUs.隶属于变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria)的OTUs占总OTUs的65.9%,变形菌门、放线菌门和酸杆菌门细菌是印度块菌-云南松菌根际土壤细菌的优势细菌.隶属于黄杆菌属(Flavobacterium)、根瘤菌属(Rhizobium)和假黄色单胞菌属(Pseudoxanthomona)的OTUs占总OTUs的33%,黄杆菌属、根瘤菌属和假黄色单胞菌属细菌是印度块菌-云南松菌根际土壤细菌的优势属.印度块菌-云南松菌根际土壤可培养细菌多样性较低,假单胞菌属细菌占据绝对优势地位.印度块菌-云南松菌根际土壤细菌类群具有较高的多样性,物种种类丰富,优势菌群集中.
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文献信息
篇名
印度块菌-云南松菌根际土壤细菌的种群组成和群落结构
来源期刊
生态学报
学科
关键词
印度块菌
云南松
菌根
细菌
高通量测序
培养
根际土壤
年,卷(期)
2018,(19)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
7066-7074
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.5846/stxb201707261351
五维指标
作者信息
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姓名
单位
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1
刘培贵
中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学重点实验室
36
538
12.0
23.0
2
闫兴富
北方民族大学生物科学与工程学院
69
513
13.0
17.0
3
刘建利
北方民族大学生物科学与工程学院
55
292
10.0
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4
邓晓娟
北方民族大学生物科学与工程学院
5
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印度块菌
云南松
菌根
细菌
高通量测序
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根际土壤
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
生态学报
主办单位:
中国生态学学会
出版周期:
半月刊
ISSN:
1000-0933
CN:
11-2031/Q
开本:
16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1981-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
14991
总下载数(次)
0
总被引数(次)
516896
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