西瓜CDPK基因家族鉴定与特征分析

• 作者: 崔博铭 崔浩楠 朱强龙 栾非时 王欣 王超楠
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 农学
• 关键词: 西瓜(Citrullus lanatus) CDPK基因家族 全基因组鉴定 系统进化
• 年，卷（期）: 2018,（17）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: S651.601
• 语种: 中文
• DOI: 10.11937/bfyy.20180692

摘要

以CDPK基因家族成员基因信息为数据源,采用生物信息学技术,对其基因及氨基酸序列特征进行分析,以期为西瓜CDPK蛋白生物学功能的深入研究提供参考.结果表明:在西瓜中共鉴定出22个CDPK家族成员,所有的ClCDPK被分为4类,多数ClCD-PK均含有6～7个内含子;氨基酸序列中含有4个EF-手型结构;在与模式植物拟南芥进行同源进化分析中,系统进化树聚类分析将所有的ClCDPK基因家族全部分为4类.