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山矾属药用植物DNA条形码序列筛选研究——以GenBank数据为例
山矾属药用植物DNA条形码序列筛选研究——以GenBank数据为例
作者:
吴楠
吴洪娥
周洪英
杨鹏
董万鹏
蒋影
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
DNA条形码
山矾属
ITS
psbA-trnH
matK
rbcL
摘要:
目的:筛选出适合山矾属植物的DNA条形码序列.方法:基于GenBank数据库中下载的43种山矾属部分药用植物的核糖体基因片段和3个叶绿体基因片段,利用遗传距离法及分子系统学进行DNA条形码分析.结果:选取的4个序列片段中,变异位点及信息位点大小均为:ITS>psbA-trnH>matK>rbcL,但4个候选序列均没有明显的Barcoding Gap,其中ITS序列在种间的变异较大,而在种内的变异较小,较符合理想DNA条形码要求.通过对ITS序列进行聚类分析,其中邻接法鉴定成功率为83.87%,贝叶斯法鉴定成功率为80.65%.结论:本研究推荐ITS序列作为山矾属植物的DNA条形码候选序列,psbA-trnH作为补充序列.
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篇名
山矾属药用植物DNA条形码序列筛选研究——以GenBank数据为例
来源期刊
中药材
学科
医学
关键词
DNA条形码
山矾属
ITS
psbA-trnH
matK
rbcL
年,卷(期)
2018,(6)
所属期刊栏目
资源与鉴别
研究方向
页码范围
1331-1334
页数
4页
分类号
R282.71
字数
语种
中文
DOI
10.13863/j.issn1001-4454.2018.06.017
五维指标
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期刊影响力
中药材
主办单位:
国家食品药品监督管理局
中药材信息中心站
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-4454
CN:
44-1286/R
开本:
大16开
出版地:
广州市中山二路24号中粤大厦10楼
邮发代号:
创刊时间:
1978
语种:
chi
出版文献量(篇)
11967
总下载数(次)
20
总被引数(次)
122072
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