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摘要:
目的:筛选出适合山矾属植物的DNA条形码序列.方法:基于GenBank数据库中下载的43种山矾属部分药用植物的核糖体基因片段和3个叶绿体基因片段,利用遗传距离法及分子系统学进行DNA条形码分析.结果:选取的4个序列片段中,变异位点及信息位点大小均为:ITS>psbA-trnH>matK>rbcL,但4个候选序列均没有明显的Barcoding Gap,其中ITS序列在种间的变异较大,而在种内的变异较小,较符合理想DNA条形码要求.通过对ITS序列进行聚类分析,其中邻接法鉴定成功率为83.87%,贝叶斯法鉴定成功率为80.65%.结论:本研究推荐ITS序列作为山矾属植物的DNA条形码候选序列,psbA-trnH作为补充序列.
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文献信息
篇名 山矾属药用植物DNA条形码序列筛选研究——以GenBank数据为例
来源期刊 中药材 学科 医学
关键词 DNA条形码 山矾属 ITS psbA-trnH matK rbcL
年,卷(期) 2018,(6) 所属期刊栏目 资源与鉴别
研究方向 页码范围 1331-1334
页数 4页 分类号 R282.71
字数 语种 中文
DOI 10.13863/j.issn1001-4454.2018.06.017
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44-1286/R
大16开
广州市中山二路24号中粤大厦10楼
1978
chi
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