丙型肝炎患者血清病毒宏基因组学研究

• 作者: 倪萍 周成林 李旺
• 来源期刊: 检验医学与临床
• 学科: 医学
• 关键词: 丙型肝炎 病毒宏基因 基因组学 病毒群落
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1737-1740
• 页数: 4页
• 分类号: R446.1
• 字数: 3363字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969／j.issn.1672-9455.2018.12.012

摘要

目的 了解健康人群和丙型肝炎病毒(HCV)-RNA阳性患者血清标本中病毒群落的组成;比较健康组与 HCV感染组血清标本中病毒群落组的差异性;挖掘新型HCV及其他新病毒.方法 提取血浆样品中的全部核酸,反转录后采用Illumina index primers进行扩增构建病毒文库,随后进行Miseq深度测序,通过生物信息学分析筛选出与病毒相关的序列.结果 HCV01文库中总病毒序列数为1 514条,主要由黄病毒科(48％)、指环病毒科(29％)、反转录病毒科(7％)、微小噬菌体科(2％)构成;HCV02文库中总病毒序列数为2 820条,主要由指环病毒科(61％)、黄病毒科(18％)、反转录病毒科(8％)、微小噬菌体科(1％)构成;HCV03文库中总病毒序列数为3 534条,主要由指环病毒科(78％)、黄病毒科(4％)、反转录病毒科(4％)、人类内源性反转录病毒科(2％)、微小噬菌体科(1％)构成;HCV04文库中总病毒序列数为3 549条,主要由指环病毒科(90％)、反转录病毒科(2％)构成.结论 血液中存在多种病毒,HCV感染患者血液中主要存在指环病毒科、黄病毒科、反转录病毒科病毒,而健康人群血液中主要为指环病毒科、反转录病毒科病毒;血清中 HCV水平可能对指环病毒科病毒的复制有抑制作用,即HCV水平越高则指环病毒科病毒水平越低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周成林	江苏省泰州市人民医院检验科	4	4	1.0	2.0
2	李旺	江苏省泰州市人民医院检验科	2	0	0.0	0.0
3	倪萍	江苏省泰州市人民医院检验科	2	0	0.0	0.0