基于基因芯片数据分析非小细胞肺癌H460细胞顺铂耐药相关的靶基因及信号传导通路

• 作者: 唐妍 张梦梅 杨泽 柏杰 柏玉举 王元艳
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 医学
• 关键词: 基因表达数据库 基因芯片 非小细胞肺癌 铂类耐药 靶基因 信号传导通路
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 分类号: R734.2
• 字数: 3294字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2018.06.001

摘要

目的 基于基因芯片数据分析非小细胞肺癌H460细胞株顺铂耐药相关的靶基因及信号传导通路.方法 从基因表达数据库(GEO)下载基因芯片数据,数据预处理后,使用R软件分析H460顺铂耐药细胞株与亲本细胞株中差异表达的基因.运用生物医学信息学方法(基因本体论使用DAVID在线软件进行分析,信号传导通路使用DAVID及Pathway在线软件进行分析)对差异基因的功能和富集的信号通路进行注释,进一步分析H460细胞顺铂耐药调控的关键基因及信号通路.结果 芯片数据分析显示,H460顺铂耐药细胞株较亲本细胞株表达水平显著上调的有7个基因,表达水平显著下调的有27个基因(P均＜0.01).基因本体论分析发现,差异表达的转录本多与肌动蛋白细胞骨架、细胞转移、细胞功能调控以及膜的组成相关.DAVID在线软件分析显示,差异表达上调的基因主要在8条通路中富集,下调基因主要在15条通路中富集.Pathway分析筛选出16条与H460细胞顺铂耐药相关的通路.结论 通过生物信息学方法对GEO基因芯片数据分析,发现了顺铂耐药相关靶基因及信号传导通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	柏玉举		44	221	9.0	12.0
2	唐妍		3	10	2.0	3.0
3	张梦梅		3	10	2.0	3.0
4	杨泽		8	32	4.0	5.0
5	王元艳		5	6	1.0	2.0
6	柏杰	遵义医学院珠海校区	1	0	0.0	0.0