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摘要:
目的 探讨人微小RNA(miR)-200a的生物学功能及其在结肠癌中的意义.方法 采用miRWalk在线工具筛选miR-200a靶基因,使用DAVID、京都基因和基因组百科全书数据库和STRING分别进行靶基因功能分析、信号通路分析和蛋白互作网络分析.从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载结肠癌的临床数据和测序数据,包括453个癌组织样本和8个正常肠黏膜组织样本,对比癌组织和正常组织miR-200a表达水平,分析miR-200a与结肠癌患者临床病理参数、生存时间的关系.结果 共筛选出200个靶基因,这些靶基因参与的主要生物过程为氧化应激反应,主要参与的细胞成分为细胞外泌体,分子功能为SH2域结合,主要参与的信号通路为miR在肿瘤中的信号通路.蛋白互作网络显示PH区域富含亮氨酸残基的蛋白磷酸酶1(PHLPP1)、富亮氨酸重复激酶2、沉默信息调节因子α相关酶1(SIRT1)、CT10调节酶(CRK)、E2F3为网络中的核心基因.结肠癌组织miR-200a表达水平高于正常组织(P<0.05);结肠癌临床分期Ⅲ+Ⅳ期者、远处转移者的miR-200a表达水平分别高于临床分期Ⅰ+Ⅱ期者、无远处转移者(P<0.05);miR-200a高表达的患者生存时间较低表达者短(P<0.05).结论 人miR-200a通过靶基因发挥多种生物学作用,其在结肠癌组织中高表达,可能与肿瘤的发生和发展有关,或可用于评估患者预后.
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文献信息
篇名 人微小RNA-200a的生物学功能及其在结肠癌中的意义
来源期刊 广西医学 学科 医学
关键词 结肠癌 微小RNA-200a 靶基因 生物信息学 生存分析
年,卷(期) 2018,(18) 所属期刊栏目 论著·基础研究
研究方向 页码范围 2173-2175,2186
页数 4页 分类号 R735.35
字数 2698字 语种 中文
DOI 10.11675/j.issn.0253-4304.2018.18.12
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 苏东星 广西南宁市第二人民医院消化内科 14 51 4.0 6.0
2 潘志刚 广西南宁市第二人民医院消化内科 8 23 2.0 4.0
3 梁肖兰 广西南宁市第二人民医院消化内科 5 1 1.0 1.0
4 肖晨 广西南宁市第二人民医院消化内科 5 18 2.0 4.0
5 郑捷 广西南宁市第二人民医院消化内科 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
结肠癌
微小RNA-200a
靶基因
生物信息学
生存分析
研究起点
研究来源
研究分支
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广西医学
半月刊
0253-4304
45-1122/R
大16开
广西南宁市东葛路20-7号
48-29
1972
chi
出版文献量(篇)
22057
总下载数(次)
12
总被引数(次)
72096
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