2016—2017年我国部分地区白斑综合征病毒wsv006的变异分析

• 作者: 万晓媛 刘庆慧 蔡苗 黄倢
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: WSSV wsv006 变异
• 年，卷（期）: 2018,（33）
• 所属期刊栏目: 动物科学·生物技术
• 页码范围: 75-79,103
• 页数: 6页
• 分类号: S945.4
• 字数: 4233字
• 语种: 中文

摘要

[目的]了解wsv006蛋白结构变异情况,并进一步为其蛋白功能研究提供参考资料.[方法]以2016和2017年在全国18个地区采集的WSSV阳性样品为模板,采用PCR方法,用特异性引物扩增wsv006基因,经连接转化后进行测序,并对测序结果进行分析.[结果]在2016年的47份样本中有9个样本,包括河北黄骅、山东日照、河北沧州和河北唐山4个地区的样本中出现了wsv006目的条带,检出率为19％.在2017年的39份WSSV阳性样本中有16个样本,包括福建霞美镇、河北黄骅、广东湛江、山东滨州、山东东营和上海6个地区的样本中出现了wsv006的目的条带,检出率为41％.氨基酸序列比对结果显示,扩增的wsv006编码氨基酸变异包括氨基酸替换、插入、缺失和提前终止翻译,其中插入的主要是脯氨酸(P)和苏氨酸(T),插入位点在第151～166位,处于PT的交叉重复区域;终止翻译是由于核苷酸第541位插入了GAGG,在转录过程中形成了终止密码子.[结论]wsv006氨基酸序列存在明显变异.