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摘要:
本研究旨对棘孢木霉基因组20个天冬氨酸蛋白酶家族基因(Asp)特性进行分析.分别进行了保守区及家族预测、氨基酸多序列比较及功能区预测、进化关系分析及其在不同培养条件下棘孢木霉中的差异表达分析.20个Asp均属Asp蛋白酶家族(PF00026),均为酸性(pI<7).有18个Asps含有信号肽.多序列比对发现Asps含有2个特征性催化指纹‘“DTGS/A”和“DT/SGS/Y/T/A/N”,根据第二个“DTGT"、“DSGT"、“DTGA/N”和“DSGY/T/S”特征性催化指纹,将20个Asps分为4个分支.进一步在C-hungry胁迫下,10个Asps基因上调,Asp54.2上调最高为3222.在N-hungry胁迫下,8个Asps基因上调,Asp50.9上调最高为33100.山新杨(Tas-PdPap)叶粉诱导后,13个Asps基因上调,Asp50.9上调最高为21078.说明棘孢木霉促杨树生长及与病原菌拮抗过程中,Asp起了非常重要的作用.
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文献信息
篇名 棘孢木霉天冬氨酸蛋白酶家族基因特性研究
来源期刊 中国农学通报 学科 农学
关键词 生物防治 棘孢木霉 天冬氨酸蛋白酶 生物信息学分析 差异表达
年,卷(期) 2018,(27) 所属期刊栏目 生物科学
研究方向 页码范围 102-110
页数 9页 分类号 S763.15
字数 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 范海娟 东北林业大学林学院森保学科 17 68 5.0 7.0
2 刘志华 东北林业大学林学院森保学科 30 153 7.0 11.0
3 王金杰 东北林业大学林学院森保学科 8 19 2.0 4.0
4 窦恺 东北林业大学林学院森保学科 4 12 2.0 3.0
5 王欣玉 东北林业大学林学院森保学科 1 1 1.0 1.0
6 季世达 东北林业大学林学院森保学科 1 1 1.0 1.0
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1000-6850
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大16开
北京朝阳区麦子店街22号楼中国农学会期刊处
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1984
chi
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