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摘要:
链霉菌FBKL4.005是本课题组前期从酱香大曲中分离得到的1株耐高温菌株,能够在37~55℃的范围内生长代谢,为了能够更深入地探究该菌株在酿酒过程中的代谢机理和功能性作用,完成大曲极端微生物开发应用,对于菌株的序列信息进行解析是最为全面高效的方式.本研究采用Illumina HiSeq 2000测序平台对菌株FBKL4.005进行全基因组测序,共得到67 771 429个reads,2.47 G的数据量,通过对测序数据进行拼接,得到69个contigs,菌株整个基因组大小为9 454 406bp,GC含量为73.03%,经过滤处理后得到7.33 Mb的有效数据量及7 946个注释基因,并通过GO、COG、KEGG、NR、TCDB数据库的比对分析,完成菌株基因组预测与基本功能的注释,获得的基因注释信息为今后深入开展酱香大曲中耐高温特性链霉菌类群代谢途径及机理的研究提供了理论支持.
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文献信息
篇名 酱香大曲中链霉菌菌株FBKL4.005全基因组测序及序列分析
来源期刊 食品科学 学科 生物学
关键词 酱香型大曲 链霉菌属 全基因组测序 基因功能注释
年,卷(期) 2018,(14) 所属期刊栏目 生物工程
研究方向 页码范围 206-212
页数 7页 分类号 Q939.13
字数 6479字 语种 中文
DOI 10.7506/spkx1002-6630-201814031
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王晓丹 贵州大学贵州省发酵工程与生物制药重点实验室酿酒与食品工程学院 45 263 9.0 12.0
2 罗小叶 贵州大学贵州省发酵工程与生物制药重点实验室酿酒与食品工程学院 9 51 4.0 6.0
3 李豆南 贵州大学贵州省发酵工程与生物制药重点实验室酿酒与食品工程学院 3 35 3.0 3.0
7 黄魏 贵州大学贵州省发酵工程与生物制药重点实验室酿酒与食品工程学院 2 16 2.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
酱香型大曲
链霉菌属
全基因组测序
基因功能注释
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
食品科学
半月刊
1002-6630
11-2206/TS
大16开
北京市西城区禄长街头条4号
2-439
1980
chi
出版文献量(篇)
24602
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