酱香大曲中链霉菌菌株FBKL4.005全基因组测序及序列分析

• 作者: 李豆南 王晓丹 罗小叶 邱树毅 黄魏
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 酱香型大曲 链霉菌属 全基因组测序 基因功能注释
• 年，卷（期）: 2018,（14）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 206-212
• 页数: 7页
• 分类号: Q939.13
• 字数: 6479字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7506/spkx1002-6630-201814031

摘要

链霉菌FBKL4.005是本课题组前期从酱香大曲中分离得到的1株耐高温菌株,能够在37～55℃的范围内生长代谢,为了能够更深入地探究该菌株在酿酒过程中的代谢机理和功能性作用,完成大曲极端微生物开发应用,对于菌株的序列信息进行解析是最为全面高效的方式.本研究采用Illumina HiSeq 2000测序平台对菌株FBKL4.005进行全基因组测序,共得到67 771 429个reads,2.47 G的数据量,通过对测序数据进行拼接,得到69个contigs,菌株整个基因组大小为9 454 406bp,GC含量为73.03％,经过滤处理后得到7.33 Mb的有效数据量及7 946个注释基因,并通过GO、COG、KEGG、NR、TCDB数据库的比对分析,完成菌株基因组预测与基本功能的注释,获得的基因注释信息为今后深入开展酱香大曲中耐高温特性链霉菌类群代谢途径及机理的研究提供了理论支持.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王晓丹	贵州大学贵州省发酵工程与生物制药重点实验室酿酒与食品工程学院	45	263	9.0	12.0
2	罗小叶	贵州大学贵州省发酵工程与生物制药重点实验室酿酒与食品工程学院	9	51	4.0	6.0
3	李豆南	贵州大学贵州省发酵工程与生物制药重点实验室酿酒与食品工程学院	3	35	3.0	3.0
7	黄魏	贵州大学贵州省发酵工程与生物制药重点实验室酿酒与食品工程学院	2	16	2.0	2.0