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酱香大曲中链霉菌菌株FBKL4.005全基因组测序及序列分析
酱香大曲中链霉菌菌株FBKL4.005全基因组测序及序列分析
作者:
李豆南
王晓丹
罗小叶
邱树毅
黄魏
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
酱香型大曲
链霉菌属
全基因组测序
基因功能注释
摘要:
链霉菌FBKL4.005是本课题组前期从酱香大曲中分离得到的1株耐高温菌株,能够在37~55℃的范围内生长代谢,为了能够更深入地探究该菌株在酿酒过程中的代谢机理和功能性作用,完成大曲极端微生物开发应用,对于菌株的序列信息进行解析是最为全面高效的方式.本研究采用Illumina HiSeq 2000测序平台对菌株FBKL4.005进行全基因组测序,共得到67 771 429个reads,2.47 G的数据量,通过对测序数据进行拼接,得到69个contigs,菌株整个基因组大小为9 454 406bp,GC含量为73.03%,经过滤处理后得到7.33 Mb的有效数据量及7 946个注释基因,并通过GO、COG、KEGG、NR、TCDB数据库的比对分析,完成菌株基因组预测与基本功能的注释,获得的基因注释信息为今后深入开展酱香大曲中耐高温特性链霉菌类群代谢途径及机理的研究提供了理论支持.
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文献信息
篇名
酱香大曲中链霉菌菌株FBKL4.005全基因组测序及序列分析
来源期刊
食品科学
学科
生物学
关键词
酱香型大曲
链霉菌属
全基因组测序
基因功能注释
年,卷(期)
2018,(14)
所属期刊栏目
生物工程
研究方向
页码范围
206-212
页数
7页
分类号
Q939.13
字数
6479字
语种
中文
DOI
10.7506/spkx1002-6630-201814031
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王晓丹
贵州大学贵州省发酵工程与生物制药重点实验室酿酒与食品工程学院
45
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9.0
12.0
2
罗小叶
贵州大学贵州省发酵工程与生物制药重点实验室酿酒与食品工程学院
9
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李豆南
贵州大学贵州省发酵工程与生物制药重点实验室酿酒与食品工程学院
3
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黄魏
贵州大学贵州省发酵工程与生物制药重点实验室酿酒与食品工程学院
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链霉菌属
全基因组测序
基因功能注释
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
食品科学
主办单位:
北京食品科学研究院
出版周期:
半月刊
ISSN:
1002-6630
CN:
11-2206/TS
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区禄长街头条4号
邮发代号:
2-439
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
24602
总下载数(次)
47
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