基于16S rRNA高通量测序方法比较新疆冷水鱼肠道中微生物多样性

• 作者: 倪永清 周红 张艳 黄丽丽
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 冷水鱼 微生物多样性 高通量测序技术
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 138-144
• 页数: 7页
• 分类号: Q935
• 字数: 4928字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7506/spkx1002-6630-201810022

摘要

为了解新疆阿勒泰地区额尔齐斯河流域野生冷水鱼肠道微生物多样性及其群落结构组成.采用NGS高通量测序技术,分析3 种冷水鱼肠道内容物和黏膜中细菌16S?rRNA?V4区基因序列,进而比较不同种类冷水鱼肠道内容物和黏膜中微生物的群落结构组成及多样性差异.结果共获得58?328?条有效序列,242?个OTU.多样性分析表明,哲罗鱼样品中的Shannon指数明显低于细鳞鱼和黑斑狗鱼,细鳞鱼和黑斑狗鱼在群落结构上更为接近.在门水平6?个样品中的菌群均以厚壁菌门(Firmicutes)、丙型变形菌门(Gammaproteobacteria)为主;哲罗鱼中Firmicutes是最占优势的菌群门,而细鳞鱼和黑斑狗鱼中Gammaproteobacteria显著增加,Firmicutes显著减少.属水平上哲罗鱼中主要以肉杆菌属( Carnobacterium )为主,细鳞鱼和黑斑狗鱼中嗜冷杆菌属(Psychrobacter)、不动杆菌属(Acinetobacter )、梭菌属( Clostridium sensu stricto )等比例较高.不同种鱼肠道微生物的组成及多样性在门和属水平上有明显差异,而同种冷水鱼的肠道内容物和黏膜间微生物群落组成较为相似,无显著差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周红	石河子大学食品学院	67	295	11.0	13.0
2	倪永清	石河子大学食品学院	71	274	10.0	13.0
3	张艳	石河子大学食品学院	30	83	5.0	8.0
4	黄丽丽	石河子大学食品学院	5	37	3.0	5.0