生物钟基因在腹部恶性肿瘤组织中的表达差异

• 作者: 何晓晓 杨盛力 毕柠瑞 汪朦朦 熊枝繁 邱梦君
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 医学
• 关键词: 腹部恶性肿瘤 生物钟基因 昼夜节律 癌症基因组图谱数据库
• 年，卷（期）: 2018,（48）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 13-16
• 页数: 4页
• 分类号: R73
• 字数: 2552字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2018.48.004

摘要

目的 探讨生物钟基因在腹部恶性肿瘤组织中的表达差异.方法 利用癌症基因组图谱数据库对14个生物钟基因(Per1、Per2、Per3、Cry1、Cry2、Timeless、CLOCK、BMAL1、NPAS2、NR1D1、NR1D2、DEC1、DEC2和RO-RA)的RNA-Seq在6种腹部恶性肿瘤(肝癌、胃癌、胰腺癌、肾癌、直肠癌、结肠癌)组织及邻近正常组织中的表达进行分析,用Bioconductor的edgeR去标准化RNA-Seq数据.结果 14个生物钟基因在6种腹部恶性肿瘤组织中均低表达.与邻近正常组织比较,肝癌组织Cry2、CLOCK、Timeless、NPAS2、NR1D1、DEC1、DEC2、RORA基因低表达(P均＜0.05),肾癌组织Per1、Per2、Cry1、Cry2、CLOCK、Timeless、NPAS2、NR1D1、NR1D2、DEC2、RORA基因低表达(P均＜0.05),结肠癌组织Per1、Per2、Per3、Cry1、Cry2、Timeless、BMAL1、NR1D2、DEC1、DEC2、RORA基因低表达(P均＜0.05),直肠癌组织Per1、Per3、Cry1、Cry2、CLOCK、BMAL1、NPAS2、NR1D1、DEC2、RORA基因低表达(P均＜0.05),胃癌组织Per1、Per3、Cry2、CLOCK、Timeless、BMAL1、NPAS2基因低表达(P均＜0.05).结论 生物钟基因在腹部恶性肿瘤组织中低表达,并且在不同类型腹部恶性肿瘤组织中表达亦存在一定差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨盛力		66	239	8.0	12.0
2	熊枝繁		76	379	12.0	15.0
3	何晓晓		11	18	2.0	3.0
4	邱梦君		8	11	2.0	2.0
5	汪朦朦		4	4	1.0	1.0
6	毕柠瑞		2	2	1.0	1.0